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Mac向けに書かれたバイオインフォマティクス本でよく使われるHomeBrewはUbuntuその他のLinuxにもインストールできます。HomebrewはMacユーザーの特権ではなく、今やLinuxやWindows WSLでも使えるというお話です。

バイオインフォマティクスの日本語でかかれたハウツー本の多くは坊農先生のもので代表されるようにMacを使って解析するものです。私はLC520あたりまではマックを使っていたのですが、新しいモデルがでたときにそれまで購入してい…

投稿日: 2023年10月9日投稿者: root

私はブラウザで再生している動画の録画にOBS studioというソフトを使っています。 https://obsproject.com/ja このソフトはゲームの中継、配信に使われることが多いようですが、デスクトップ画面や…

投稿日: 2023年10月3日投稿者: root

GROMACSは。”A free and open-source software suite for high-performance molecular dynamics and output analy…

投稿日: 2023年9月30日投稿者: root

講談社のブルーバックスの本をKindle unlimitedでいろいろ借りて読んでいます。以前紹介した「分子レベルで見た薬の働き」、「分子レベルで見た体の働き」という平山令明先生の本では、本文でとりあげられているタンパク…

投稿日: 2023年9月25日投稿者: root

AmazonのKindle unlimitedに大量のブルーバックスが入っているのを以前紹介しました。こちらのAmazonのツイートによると10/31終了予定とのことです。【Kindle Unlimited】創刊6…

投稿日: 2023年8月7日投稿者: root

PyMOLでは、PDBのサイトにあるタンパク質なら、登録番号をいれるだけで一発で立体構造を表示できます。しかし、AlphaFold2で予測されたpdbファイルはPDB のサイトにはないので、AlphaFold　Prot…

投稿日: 2023年7月17日投稿者: root

MRC LMBのバイオインフォマティクス入門ビデオの紹介です。これはバイオインフォマティクスを鳥瞰図的に紹介してどんなツールやデータベースがあるか、バイオインフォマティクスを使いこなすには何を学べばいいのかを紹介するT…

生物学者のためのR入門の英語サイトがあります。カナダのQueen’s Universityの研究者のサイトです。 https://colauttilab.github.io/RCrashCourse/1_fu…

投稿日: 2023年7月7日投稿者: root

MathematicaのUbuntuへのインストール方法：　　今回はMathematicaをUbuntu 22.04.2 LTSという最新版のLinux distributionにインストールしました。やり方を簡単にメモ…

先日 MRC LMBのセミナーで、Brady Johnstonさんの講演「Blending proteins- Democratising access to beautiful molecular landscapes…