生命科学ではAIはどれほど役立つのでしょうか、まだ学部レベルという話も聞きますが本当でしょうか?―TogoTVの動画を紹介します。

トーゴーの日シンポジウム2026
『AIが研究する時代のデータベース』という催しが10月5日に開催されて、その動画が公開されました。

https://biosciencedbc.jp/event/symposium/togo2026/
https://biosciencedbc.jp/event/symposium/togo2026/talk/

招待講演がとても面白くわかりやすいので是非ご覧ください。
『AI駆動型生命科学研究の実現に向けて』(奥野 恭史(京都大学))
https://togotv.dbcls.jp/20261101.html
動画はYouTubeでも視聴できます。
https://youtu.be/A9VjVc4F_ko

生命科学における現在のAIは、実験科学分野では大卒かせいぜい修士レベルなのだそうです。またAlphaFoldの立体構造予測は学習データに大きく依存しており、学習データがそろっていないタンパク質の立体構造は予測に失敗するとのこと。たとえばBRCA1 (乳癌遺伝子)の構造すら予測できないという例もでてきます。創薬とAI, 新しいデータベースのあり方などについても解説されており、必見の講演だと思いました。
また次のパネルディスカッションも必見です。

『パネルディスカッション「AI が研究する時代のデータベース」』
高木 利久, 伊藤 隆司, 奥野 恭史, 片山 俊明, 木下 聖子, 鈴木 穣
こちらは九大の伊藤先生や、一緒に研究させてもらっている創価大の木下先生も話題提供されているパネルディスカッションの動画です。
https://togotv.dbcls.jp/20261106.html
https://youtu.be/AmWMc_MXLto

とうとう内閣府を騙る詐欺メールまで届きました!プロバイダの迷惑メールフィルターがとても有効なようです!

NHKニュースでも、国税庁を騙る詐欺メールの激増が報じられていました。現在わたしが行っている詐欺メール対策の一つにプロバイダが提供する迷惑メールフィルタの利用があります。今日はその話です。

1)プロバイダによる迷惑メールフィルタの利用はとても有効だとわかりました。私は先日大規模なメールアドレスの流出を起こしたbiglobeのメールアカウントをもっているのでbiglobeを例に説明します。biglobeの場合、スパムメールフィルタサービスの無料版と有料版があります。
https://email.biglobe.ne.jp/spam/

無料版ではスパムメールと判断したメールには、メールのsubjectの部分の先頭に[spam]と入れて配信してくれるだけです。これだけでもずいぶん助かります。メールの削除などを自動でやってくれるようにすると、大事なメールが削除されていないかをプロバイダの提供するレポートなどで確認しなくてはならないので、有料のブロックサービスよりも、スパムの印をつけて配信してくれる無料サービスを使って自分のメールソフトで振り分けるほうが効率がよいと思います。ここ数日無料サービスをためしていますが、見事にスパムメールだけをとらえているようで、biglobeを使っている方にはこの迷惑メールフィルタをおすすめします。他のプロバイダの迷惑メールフィルタも色々あると思いますので各自のサービスで試してみてください。下の写真は最近の迷惑メールが見事にbiglobeの迷惑メールフィルタで捕捉されている例です。

今日はとうとう内閣府を騙るメールまで届き出しました。しかし見事にspamメールとして捉えられています。

Amazonを騙るメールもとどきました。これもちゃんとspam印がついて配信されています。

どれも、Fromに空白や左右逆順にする制御文字をいれたりしている最近はやりの迷惑メールです。全部biglobeの迷惑メールフィルタが補足しています。素晴らしい精度です。

2) メールが届いたら、受信したメールソフトのメールの振り分け設定を使って迷惑メールを一つのフォルダに移動させて集めます。[spam]の印がついたメールを振り分け設定で、スパムメールフォルダなど自分のわかりやすい名前をつけたフォルダに振り分ければOKです。振り分けられたメールをみて、重要なものが誤ってスパムメール担っていないかを確認してから消去しましょう。

3)biglobeのメールシステムでは送信元を偽装しているメールを受け付けないDMARCを採用しています。DMARC(ディーマーク)は、メールの送信者が名乗っているドメインを本当に使用する権限があるかを確認し、偽装が疑われるメールを受信側でどう処理するかを決める仕組みです。Domain-based Message Authentication, Reporting, and Conformance の略です。これは送信するメールアドレスをたとえば国税庁の公式アドレスにして送信してくる詐欺メールを排除できるシステムです。しかし詐欺師がメールアドレスに使われるドメインを所有していたり、紛らわしいメールアドレスを使ったりしてDMARCが動いていても詐欺メールが排除できない場合もあるそうです。しかしDMARCがあると多くの詐欺メールの排除効果が期待できるので、ご利用のプロバイダのメールシステムがDMARCに対応しているかどうかは確かめてみるとよいでしょう。詳しく知りたい方はネット検索やAIにDMARCについて質問してみてください。結構、詳細な解説をしてくれます。

PLaMo 3 Translateという国産翻訳LLMを試しています。

PLaMo 3 Translateは先日公開された翻訳に特化したLLMです。以下のツイートをご覧ください。


このモデルを試すのに最適なソフトが公開されています。
PLamo Translate Desktopです。
https://github.com/tanakh/plamo-translate-desktop/blob/main/README.ja.md
Windows10以上のWindows, Mac OS, Linuxで使えます。私は今日、Windowsで試しています。こちらから各OS用のソフトがダウンロードできるのでチェックしてみてください。
https://github.com/tanakh/plamo-translate-desktop/releases
Windowsならこちらです。
起動すると、モデルの選択画面が出てご自分のパソコンやスマートフォンに適したモデルをダウンロードして使います。ダウンロードが終わったらネット接続なしで利用できます。またブラウザと連携することもできて、ブラウザで開いたページの翻訳も可能です。さらにブラウザの機能拡張だけもダウンロードして利用できます。
私はモデルを2Bにして試しましたが、翻訳したいテキストをペーストすると自動的に翻訳が始まります。
例えばこんな感じで翻訳してくれます。

GPUのない私のノートパソコンでは8Bは遅くて実用になりませんでした。2Bはさくさく動きます。なかなかよさそうなソフトです。もちろん日本語の文章の翻訳もできあますし、翻訳は53言語に対応しているそうで、ものすごいですね。みなさんも色々試してみると役立つと思います。

RとStanで学ぶ実験・行動経済学のための構造ベイズ手法という経済学研究・学習用の無料の教科書が公開されています

Structural Bayesian Techniques for Experimental and Behavioral Economics
With applications in R and Stan

この、『実験・行動経済学のための構造ベイズ手法』という教科書はミクロ経済学の研究に構造ベイズ手法がどのように活用できるかが学べる無料公開中の教科書です。推論というと因果推論の話が多いですが、この本は構造ベイズ手法による推論をあつかっていてこの種の本が少ないため貴重な本だそうです。多くの計量経済学・実験経済学コミュニティやワークショップ等のテキストとして採用されており、高い評価を受けている教科書です。Rと、ベイズ解析の定番(生命科学や統計学、経済学、創薬、臨床研究などでの定番)の確率的プログラミング言語(PPL: Probabilistic Programming Languages)であるStanを用いて手を動かしながら最新の手法まで解説している研究方法の実例付き教科書と言える本です。「行動経済学の理論をRとStanでどう実装するか」に特化しており、実験経済学者や大学院生向けの学習リソースとして高く評価されているそうです。Rの基本操作やStanの文法、ベイズ統計の基礎(MCMCの収束診断など)、およびミクロ経済学・期待効用理論の概念などを知っている人向けの教科書ですが、行動経済学ってどんな研究をしているのかを実例付きで知ることができるので経済学に興味のある人には役立つ本だと思います。
pdf版はこちらからダウンロードできます。
https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=5241268
html版はこちらで読めます。頻繁に新しい章が書かれているので新鮮な教科書になっており、html版をチェックすることをおすすめします。
https://jamesblandecon.github.io/StructuralBayesianTechniques/section.html

著者のツイートをみると、新しい内容が入るたびに告知されているようです。

是非視聴しておきたい生命科学系の動画を2本紹介します。

今日は2本、YouTubeで最近公開された動画を紹介します。これはじっくり見ておきたいと思った動画ですので、よかったらご覧ください。どちらも素晴らしい動画です。

一本目は、東京大学理学部のオープンキャンパス2026の動画です。DNAの塩基配列の決定(シークエンシング)に革命をもたらしたナノポア・シークエンスについて高校生にもわかるように、そして本格的に解説している素晴らしい講演です。ヒトゲノムの配列決定が今や1日以内に可能になった技術について知るには最適の動画です。
東京大学理学部オープンキャンパス2026 講演「ナノポアを用いた単分子計測技術」柳至准教授
https://youtu.be/V-YDW8OV0Bs

もう一つの動画は、英国Royal Societyでの講演動画です。これは自然界に全く存在しないタンパク質を人工的に設計して作成する話です。タンパク質のアミノ酸配列は進化の結果に制約されていると考えられていますが、この講演では、全く既存のタンパク質の配列に基づかない、独自の設計のタンパク質の合成がどんどん進みつつあるのがわかります。

The Croonian Medal 2026 を授与されたDr David Baker (タンパク質の立体構造予測やコンピュータで新規タンパク質を設計する研究で有名。ノーベル化学賞を2024年に受賞)による受賞講演(クルーニアン講演)です。AI時代のタンパク質設計についての最新の状況を学ぶのに最適な演者による、すばらしい講演です。
Advances in computational protein design | The Royal Society
https://www.youtube.com/live/1mu3x97th90

NIH videocastの動画を視聴する方法3回目―ライブ配信の視聴方法

NIH videocastの最新の講演が、配信サービスで見られるようになるにはこのところ1月ほどかかる模様です。
すぐに最新の講演をみたいという人むけに、今日は最新の講演をライブで視聴する方法を紹介します。

1)まずどんな講演がこれからあるかをEvent Calendarのサイトで確認します。 スクショを貼り付けておきます。
開催日、開催時間、一般公開されているかNIH onlyで一般に非公開かなどがわかります。NIH onlyのものは一般人はみることができません。

2)上のスクリーンショットの11月13日開催のNLM Colloquia: Biomedicine in the Age of Foundation Models and Agentic AIという講演を視聴することにします。Event Detailsのボタンをクリックすると次の表示がでてきます。

このスクショでわかるように、
視聴したい講演をクリックすると、「This is an upcoming VideoCast event. To watch, visit the provided URL on the event day…」と書かれた事前ページ(UUID形式の固有URL)が開きます。ページ内のカレンダー追加ボタンを使うか、そのURLをそのままブックマークしておきます。時間がきたらブックマークしたページを開いて視聴します。Live配信の場合は、NIH Videocastのトップページhttps://videocast.nih.gov/でもみることができるそうです。Live Now(現在配信中)と表示されている部分から視聴できます。

3)開催時日時についての注意です。
今回の例では、Event Detailsのページには2026年11月12日 午前10時55分から正午までの講演とあります。ここの表示は日本時間ではないので注意しましよう。現地時間のEST表示であることに注意してください。ESTは東部標準時で冬時間(標準時)であることを示しています。夏時間はEDTと表示され、ETは冬時間と夏時間どちらにも使える便利な表現です。米国は11月第1日曜日(2026年は11月1日)に夏時間(EDT)から冬時間(EST:標準時)へ切り替わったため、現在の時差は14時間(日本の方が14時間進んでいる状態)です。この講演が開始されるESTの11月12日午前10時55分は、日本時間の11月13日午前0時55分になります。 この日本時間がブラウザのEvent Calendar(上のスクショ)のほうには表示されているので、混乱しないように注意してください。

日本からライブ視聴する際の時差の目安(米国東部時間 ET → 日本時間 JST)

WALS(水曜午後レクチャー):現地時間 水曜 14:00〜15:00 EST = 日本時間 木曜 午前4:00〜5:00
Demystifying Medicine(火曜午後): 現地時間 火曜 16:00〜18:00 EST =日本時間 水曜 午前6:00〜8:00
午前開始のシンポジウム・評議会(Council):現地時間 午前9:00〜10:00開始 EST = 日本時間 当日 23:00〜翌0:00開始

午前開催のシンポジウムや、火曜夕方の「Demystifying Medicine」(日本時間の水曜朝6時〜)などは、日本の生活時間帯でも比較的リアルタイム視聴しやすい枠となっています。

4)Live ストリーミングの録画:OBS Studioで録画するのがよいでしょう。OBS Studioの使い方についてはこのブログでも何回か紹介していますので、検索してみてください。

NIH videocastを視聴する方法 第2回目―字幕のない動画の字幕を自動生成する方法

今日は、NIH videocastの字幕がついていない動画で、字幕を生成する方法を紹介します。この方法は、どんな動画でも使えますので自分のパソコンの動画をChromeにドラッグ・アンド・ドロップして字幕を生成させるのも簡単です。
Chromeで字幕がついていない動画の字幕を表示させる方法:Chromeの自動字幕おこしをオンにして動画を再生すればOKです。Chrome上部のアドレスバー(URLを入力する欄)に chrome://settings/accessibility と入力してEnterキーを押します。次のスクショのような画面が開くので、自動字幕起こしをオンにします。

自動字幕起こしなので、間違いもありますが動画を開く、あるいは動画をブラウザにドラング・アンド・ドロップするだけで動画が再生されて字幕が表示されるようになります。
字幕の表示ボックスはドラッグして好きな部分に動かすことができますので、みやすいところに表示させます。また字幕ボックス右上のピン留めアイコンをクリックしておくと、別のタブをひらいていても字幕だけは表示できるので他の作業中でも字幕を確認することができます。ブラウザの外に字幕を表示させると、スライドが隠れないので便利です。

しかし、上のスクリーンショットの状態では字幕が二行しか表示されないので不便です。
字幕の表示行数を増やすには、字幕ボックスの下にある丸で囲まれた下向き矢印をクリックします。するとこんなふうに表示行数が増えて実用的になります。

今例に上げているのはmp4形式の動画を、Chromeブラウザの表示ページにドラッグ・アンドド・ロップして再生させているものです。英国の講演ですがほぼ完璧に正確な英語の字幕がついています。字幕の表示画面を広くするのと、字幕表示をドラッグ・アンド・ドロップして動画の再生画面の外で表示させる(ブラウザの外に引っ張り出して字幕画面を表示できます)だけでスライドの画面を隠さずに字幕を読めるのでお試しください。

字幕の設定はこの記事の最初のスクリーンショットにある、字幕の設定からおこなうことができるはずです。ただ私のWindows10の環境で今試しているのですが、設定して字幕のプレビューではうまく設定できたナズなのに、実際の動画を再生して字幕を生成させると反映しない項目が多いです。今、試しているところなのでうまく行ったらまたお知らせします。

NIH videocastを視聴する方法―第一回目

NIH video castのYouTubeチャンネルは最近更新が止まっていて最新のものでも7ヶ月前の動画しかアップロードされていません。NIH videocastのサイトで過去動画Past Eventsを見る方法を今日は紹介します。次のページを開きます。
https://videocast.nih.gov/past-events
最近の過去動画から古い(2000のものまで)までの動画へのリンクがここからたどれます。昔は数日で動画が公開されていたのですが、最近は講演があってからだいたい一ヶ月後くらいから動画が公開されるようです。それで今みることができるのは10月はじめくらいの講演動画以前のものです。(最新の動画をみたい時は、ライブで見るしかないのでその方法は明日書きます。)
古い動画は検索窓にキーワードを入れて検索します。たとえばEnglish writingといれてみましょう。

動画が次のようにでてきます。

科学英語の話し方、書き方(実験プロトコルの書き方とか、Grant申請書の書き方講座、レジュメの書き方、論文の書き方など)のNIHの動画がいろいろあるので参考にしてください。NIH Qnlyの表示があるものは視聴できません。私はImproving spoken Englishを以前、学生さんに薦めていたことがあります(記事へのリンクはこちら)。今日は他の動画をクリックした画面をスクショしておきます。

検索窓に他の単語を色々入れてでてくる結果で面白そうなものをクリックして視聴するとよいでしょう。検索窓にはANDとかORとかを使うことはできないそうです。単語をならべるのが最も簡単です。”mass spectrometry”などのようにquotation markで囲むと、正確に一致するものだけがヒットします。

このようにして、NIHの過去の講演動画を再生できます。しかしダウンロードはできません。これは配信方法がHLSという形式(HTTP Live StreamingというものでAppleが開発して広く使われるようになったもの)に変わったためで、従来のようにmp4などの動画をサイトにおいてあるわけではないからです。画質も最近の動画はHLSが勝手に回線にあわせた画質で送信してくるため変更できないようです。また上のmass spectrometryの動画は字幕がありませんが、これはNIHの配信するものは正確でなくてはならないというルールがあるため、人が字幕を検閲して正確なものにするのに時間をとっているからだそうです。字幕の完成しだい字幕がみられるようになるそうです。それまではChromeなどで自動生成字幕を表示させる他ないでしょう。その方法も明日書くことにします。

今度はamazonを騙る詐欺メールが届きました。詐欺メール振り分け法の紹介です。

今朝、メールをみるとamazonからと称するメールが迷惑メールフィルタをすりぬけてとどいていました。メール一覧には、【Amazon 配送サービス】と表示されていますが、下のスクショにあるように、メールのFrom欄を見ると、文字が左右逆順に表示されているのがわかります。空白もはいっていますね。

メールの本文をみると、置き配にするのに、アプリをダウンロードして設定してくれなどという文面です。

こういう詐欺メールには、迷惑メールフィルタをすりぬけるために文字列を逆順に反転する文字(Bidi制御文字)を含むものがあるそうです。これを迷惑メールフィルタに移動させるには、お使いのメールソフトの振り分け条件設定でこうした逆順表示を含むものをよりわけるのが良いと思います。


振り分け条件の設定画面で、
From:が次の正規表現と一致するもの、と指定します。
正規表現:[\x{200B}-\x{200D}\x{202A}-\x{202E}\x{2066}-\x{2069}]

念のため、「あるいは(OR)」の条件設定で、
Subject:のほうにもこの正規表現と一致するものという条件をつけておけば万全でしょう。


以前の国税庁を騙るメールの設定の記事も参考にどうぞ。Bidi制御文字についても紹介しています。Bidiというのはbidirectionalのことだと思います。

国税庁をかたる巧妙な詐欺メールを回避する方法

夏目漱石が推理小説を書いているって 本当でしょうか?

小学生のころ、はじめて読んだ新書に 『勉強が好きになる本』(KAPPA BOOKS)というのがあって、著者が林 髞(はやし たかし) 慶応義塾大学医学部生理学教室主任教授とありました。パブロフのところに留学した人で大脳生理学の日本での開拓者の一人みたいですね。この人が、ペンネームの木々高太郎という名前で推理小説を書いているとは知りませんでした。林 髞という本名の漢字をバラバラにしてこしらえたペンネームですね。


この人の著作を国立国会図書館デジタルコレクションの検索で探すと、著者名に木々高太郎と入れて探したのですが、一冊しかヒットしませんでした。ところが、国立国会図書館サーチ https://ndlsearch.ndl.go.jp/で、著者名に木々高太郎と入れて探したところ、69件ヒットしました。図書だけなら14件ヒットしていることが、スクリーンショットからわかると思います。

上のスクショのように検索すると、なんか面白そうな本がみつかりました。文芸推理小説選集 第5 (夏目漱石,木々高太郎集)というタイトルの本です。夏目漱石の推理小説があるのでしょうか?


次に、この本の巻末の「解説」への直リンクをはっておくので、知りたい方は是非ご覧ください。
https://dl.ndl.go.jp/pid/1646330/1/170