The Nomura Institute of Glycosciece Blog

カタストロフィーの理論についてはこのブログでたびたび触れています。ChatGPTやGeminiに、カタストロフィーの理論は今、どのように評価されているのかをきいてみました。最近の文献や動画を探してもらったのですが、結構応用されていてその改良も試みられていることがわかりました。今日はWaddingtonのエピジェネティック・ランドスケープをカタストロフィーの理論で再構成して幹細胞の分化モデルを構築し、発生における分化の研究に使えるものにしたという論文があったのでタイトルを紹介しておきます。

Sáez M, Blassberg R, Camacho-Aguilar E, Siggia ED, Rand DA, Briscoe J. Statistically derived geometrical landscapes capture principles of decision-making dynamics during cell fate transitions.
Cell Syst. 2022 Jan 19;13(1):12-28.e3. doi: 10.1016/j.cels.2021.08.013. Epub 2021 Sep 17. PMID: 34536382; PMCID: PMC8785827.
オープンアクセスなので自由にダウンロードして読むことができます。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405471221003367
読む前に概要をつかむのに便利な次の紹介記事があるのでまずこれから読むとよいでしょう。
The geometry of cell fate
Cell Systems, Volume 13, Issue 1, 19 January 2022, Pages 1-3
Ben D. MacArthur

Sara Franceschelli
“The gap between theory and experience: evolution of a problem from morphogenesis to semiophysics”
https://youtu.be/Lh86tKH0dbU

カタストロフィー理論を「モデルの技法」としたThomと、Waddington landscape、経験的検証との関係を論じます。

Chérif Matta
“René Thom’s Catastrophe Theory and the Quantum Theory of Atoms in Molecules”
電子密度トポロジー、化学結合、QTAIM ( The Quantum Theory of Atoms-In-Molecules)との関係です。
https://youtu.be/p_UtxwOIhHk

量子化学での応用が定着していることがわかります。

Antoine Danchin
“Comment René Thom a changé la biologie moléculaire”
https://youtu.be/qBOsgGF1Cu8

分子生物学への思想的・方法論的影響を扱います。

あとは埋め込みませんが、分子生物学への応用や、アリストテレスに発する哲学的なトムのアイデアの解説など面白そうな動画があるのでご覧ください。フランス語の動画もありますが、たいていは英語です。フランス語の動画は、英語字幕がでますのでそちらで視聴できると思います。
Jean Petitot
“Trois remarques sur les modèles morphologiques de René Thom”
反応拡散モデル、アリストテレス的形相論、視覚認知の神経実装との関係を検討しています。

Daniel Bennequin
“René Thom and semantic information”
Shannon型の統計的情報とは異なる「意味の情報」と、トポロジー・ニューラルネットワークとの接続を論じます。

Wolfgang Wildgen
“René Thom’s archetypal morphologies of human language and his semiophysics applied to visual art and music”
言語学・記号論・美術・音楽におけるThomの影響を検討しています。

NHKの番組　『歴史探偵』で宮本武蔵をやっていました。
”7/15(水)午後10:00　歴史探偵「宮本武蔵　最強伝説の真実」”
まだ見ていない方は、NHK ONEでやっていますが、地上波での再放送が
7月20日(月)午後11:50〜午前0:35（再）にあるとのことで、面白い番組なのでおすすめします。
https://www.nhk.or.jp/yamaguchi/info/articles/310/057/50/

私の住んでいる福岡県には巌流島（船島）がありますし、宮本武蔵の養子だった伊織が建立した小倉碑文（武蔵の顕彰碑）もあります。この番組では両方とも紹介されていて今度行ってみたいと思いました。さらにすごいのは武蔵の生国の解明につながった伊織の棟札（加古川市にある泊神社の屋根裏から発見されたもの）も映されていたことです。また京都で吉岡一門と戦った一乗寺下り松と神社も紹介されていました。つばめ返しの再現も面白かったです。
宮本武蔵は小説では関ヶ原の戦いに西軍で参加したことになっていましたが、今では東軍に属して九州で戦っていたことがわかっているそうです。またこの番組では触れられていませんでしたが、大阪の陣でも徳川方に属して戦っていた資料があるそうです。ずっと徳川方に属していたということで、徳川方の明石で、街の町割にたずさわっていたというのもうなずける話です。
昔のブログ記事を最後にペーストしておきます。参考にどうぞ。

2022/2/26
アニメ「鬼滅の刃」が大人気だそうで地上波でもやっていましたのでちらっと見ました。テレビによると福岡の竈門神社(かまどじんじゃ)がこのアニメの聖地になっているのだそうです。主人公の名字と同じだからということらしいです。以前、紅葉をみにいった記事でふれた大宰府天満宮近くの神社です。新型コロナ以前は中国の観光客でいっぱいでしたが、今は国内観光客ばかりですが多くの人が訪れているそうです。この神社、たしかに武道とも関係がある神社です。2019年の秋、はじめて訪れたとき、本殿の横をみて驚きました。本殿の隣に神社がありなんと、神道夢想流杖道発祥の地と書かれています。夢想権之助神社です。夢想権之助は、剣豪宮本武蔵に挑んで敗れたのですが、この神社近くの宝満山にこもって修行し開眼。杖術を創始してそれで宮本武蔵と再度試合して勝ちを収めたとも伝えられています。杖術は福岡藩に伝えられ受け継がれて、現在の警察でも採用されているそうです。言い伝えによると、夢想権之助は宮本武蔵が晩年熊本に居を構えて五輪の書を書いているときにもしばしば訪れて交流していたそうです。ということで竈門神社はまさに鬼滅の刃の聖地にふさわしい場所であるわけです。

NHKニュースで知りました。日本ではじめてノーベル医学・生理学賞を受賞した分子生物学者です。バーゼルの免疫学研究所でされていた仕事でノーベル賞を受賞、後に脳の研究などもされており、理化学研究所の脳科学総合研究センターの所長をされていたこともあります。昨日、なぜか昔買った立花隆さんとの対談本『精神と物質』をパラパラながめていたところでした。この本は結局通読しなかった本です。パラパラながめるので十分な本だと、私は思いました。

利根川進さんの書かれたものを無料で読むには、国立国会図書館デジタルコレクションの個人送信サービスがよいでしょう。
読める主な本を並べておきます。
・利根川進 [著] ほか『創造への挑戦 : 利根川進の世界』,協和発酵工業,1989.4. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/13286367 (参照 2026-07-16)
これは利根川進さんの講演と対談が載っている本です。巻頭のカラー写真には利根川さんの楽しそうな写真もあっておすすめです。

・中京テレビ「対談21世紀」 編『21世紀論 : いま何を考えるべきか』,ビクター音楽産業,1993.1. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/13080384 (参照 2026-07-16)　巻頭に利根川さんと ノーベル物理学賞受賞者の江崎玲於奈さんとの対談が載っています。

・松井孝典 編著 ほか『最後の選択 : 文明・人類はどこへ行くのか』,徳間書店,1994.2. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/13164449 (参照 2026-07-16)　こちらは松井孝典さんと利根川さんの対談と利根川さんの論考が載っている本です。他にもいろんな人の対談や論考がのっていて、ドーキンスの論考やプリゴージン（ノーベル賞受賞者）と松井さんとの対談ものっていたりします。面白そうですので読んでみるとよいでしょう。

細菌学者の野口英世は有名で1000円札になっていましたが、細菌学者の北里柴三郎の新1000円札もすっかりおなじみになってきたと思います。こうした日本の細菌学者についてまとめられた素晴らしい本があるので紹介します。大阪大学出版会からでている

阪大リーブル 80の「明治・大正・昭和の細菌学者たち　北里柴三郎から藤野恒三郎まで」（竹田美文 著）
という本です。
https://www.osaka-up.or.jp/book.php?isbn=978-4-87259-651-9

国立感染症研究所の所長をしておられた竹田美文先生の力作です。
日本の近代医学の夜明けにあたるシーボルトや適塾からはじまり昭和初期の細菌学者までその業績が一般人でもよくわかるように読みやすく書かれています。5000円札になっている発生生物学を学んだ津田梅子についてのコラムもあるので、お札にでてくる3人の学者のことはこの本で全部わかります！
内容は、上の大阪大学出版会のサイトに目次や内容紹介があるので是非ご覧ください。
わが国の近代医学の祖　北里柴三郎の世界的業績、志賀潔の赤痢菌の発見、秦佐八郎の梅毒治療薬の発見、野口英世の研究、病原スピロヘータの発見者（稲田龍吉、井戸泰、二木謙三、谷口腆二）らと野口英世の交流、、長與又郎による　つつが虫病病原体の発見、谷口腆二による大阪大学微生物病研究所の創設、大原八郎の野兎病病原体の発見、藤野恒三郎による腸炎ビブリオの発見など盛りだくさんの内容ですがすらすら読み進むことができます。私たちは志賀毒素の研究やレプトスピラの研究もしていたので、志賀潔の章と九大の稲田、井戸によるレプトスピラ研究開拓の歴史は特に興味深く読めました。野口英世の章では、研究の再現性についてとかく悪く言われることが多い野口の、世界的業績についての再評価がなされており、野口英世について語る人は、小説や俗説ではなく細菌学者によるこの本を読んでから語るべきだと思いました。必読書です。