The Nomura Institute of Glycosciece Blog

今日はNIHの動画の紹介です。
Demystifying Medicine – Out of Africa: Genomic and Environmental Determinants of Global Healthというタイトルです。
https://videocast.nih.gov/watch=48839　演者はCharles Rotimi, （PhD, NHGRI, NIH） と Clement Adebamowo, （BM, ChB, ScD, FWACS, FACS, University of Maryland）のお二人です。
人類がアフリカ起源というのは有名な話です。今日の二人の演者は、アフリカでゲノム配列の解析を行っている方と、それをアフリカでの病気の研究に活用している方です。人類のアフリカ起源の証拠やホモサピエンスの起源、そしてゲノム解析の結果のわかりやすい解説と病気の解析への応用について学べるので、是非ご覧になることをお勧めします。昔、このNIHのvideo castで見た講演では、世界各地の集団のゲノム解析をした結果、アフリカ起源の集団のゲノム配列は、それ以外と際立って異なっており、ありえないことですが、もし今後全く交配がなかったら別の種になってしまうだろうという話をききました。最新の研究ではどうなっているのでしょうか。是非、最新の研究成果を聞いてみてください。
実はChatGPTに講演の字幕をダウンロードして要約してもらおうと作業していました。字幕のダウンロードファイルから必要なテキストを整形するのに手間取っていて、今日は要約ができませんでした。そのままテキストファイルをChatGPTに与えると長すぎるといわれてできなかったので、明日いろいろ試してみようと思っています。

今日はふと、漱石の漢詩のことを思い出しました。両頭の蛇についての漢詩です。
　　 快刀切断両頭蛇　　
　　不顧人間笑語譁　　
　　黄土千秋埋得失　　
　　蒼天万古照賢邪　　
　　微風易砕水中月　　
　　片雨難留枝上花　　
　　大酔醒来寒徹骨　　
　　余生養得在山家
読み下し文はこうなります。

　　　　快刀　切断す　両頭の蛇
　　　　顧りみず　人間(にんげん)　笑語譁(かまびす)すしきを
　　　　黄土　千秋　得失を埋ずめ
　　　　蒼天　万古　賢邪を照らす
　　　　微風　砕き易し　水中の月
　　　　片雨　留め難し　枝上の花
　　　　大酔　醒め来りて　寒さ骨に徹し
　　　　余生　養い得て　山家に在り

これは漱石が東京を去って、四国の松山中学校に教師として赴任してひと月くらいの頃に作って、入院中の畏友正岡子規あての手紙（明治28年5月28日の書簡）に書いた漢詩です。作品「坊ちゃん」のもとになる体験をした四国生活ですが、その際の覚悟を詠んだ漢詩とされています。
漱石の漢詩を高く評価し、岩波新書の「漱石詩註」を書かれた吉川幸次郎先生によると、漱石の漢詩の語法は正確で中国人で激賞するものがあるほどだそうです。語学の天才と言われる漱石の面目躍如たる漢詩です。吉川先生によると漱石の漢詩は、漱石の文学において大きな比重を占めており、おそらく漱石の俳句よりも大きな比重を占めているのだそうです。この漢詩の最初にある両頭の蛇は次の故事をもとにしています。

“楚の孫叔敖（そんしゅくごう）が子供の時、両頭の蛇を見た。それを見たものは死ぬという言い伝えがある。自らの死を覚悟するとともに、あとから来たものが再び見るといけないと思い、蛇を殺して埋め、泣きながら家に帰ると母は言った。「憂うる無かれ。汝は死せず。吾聞く、陰徳有るものは、必ず陽報有りと。」のち果たして、楚国の宰相となった。先生の理想もまた後人のために、いろんな両頭の蛇を、切断し、葬り去ることにあった。その結果として、いろいろと批評されるのは、顧慮すまい、というのが次の句の不顧人間笑語譁である。なおここにある人間というのは、俗人の世界、世間というにひとしい、とのことです。“　（漱石詩註　岩波新書　p17-18より一部改変して引用）

この話の原典は以下などで知ることができます。
https://hokkyodai.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=8853&item_no=1&attribute_id=13&file_no=1

孫叔敖（そんしゅくごう）嬰児（えいじ）たりし時、出遊して両頭の蛇を見、殺して之を埋む。帰りて泣く。其の母其の故を問ふ。叔敖対へて曰はく、 「聞く、 『両頭の蛇を見た者は死す。 』と。嚮者（さき）に吾之を見れば、母を去りて死するを恐るるなり。 」と。其の母曰はく、 「蛇今安くんにか在る。 」と。曰はく、 「他人の又見んことを恐れ、殺して之を埋む。 」と。其の母曰く、 「吾」聞く、 『陰徳ある者は、天報ゆるに福を以てす。 』と。汝死せざらん。 」と。長ずるに及びて楚の令尹（れいいん）と為る。未だ治めずして国人其の仁を信ぜり。 『新序』より。

皆さんも人生で、両頭の蛇を切断する機会がきっとあると思います。その際には、なぜか忘れがたい この漢詩と故事を思い出してがんばってください。

Turingは計算科学の創始者で、コンピュータ科学に燦然と輝く業績をあげた数学者ですが、彼が書いた生命に関する唯一の論文は、生物の形づくりの理論を開拓したもので実験的にも彼の論文で取り上げた反応拡散方程式が働いていることが確認されています。このTuring Patternはとても有名ですが、彼が暗号解読者として、第二次世界大戦のイギリスの勝利に大きく貢献したのをご存知でしょうか。最近NHKのBSでやっていた映画Imitation gamehはTuringが主人公の映画でした。https://youtu.be/ddG9uev2c0U
彼は戦争中、Staiton Xという英国の秘密組織でドイツのエニグマ暗号の解読に携わっていました。彼のアイデアと、Station Xで開発されたコンピュータの元祖ともいえるコロッサスとよばれる装置によってエニグマ暗号が破られたと読んだことがあります。
今日紹介する動画は、彼の属したStation Xがいかにエニグマ暗号を解読したかを、じっくり教えてくれるドキュメンタリー番組です。
Inside Britain’s Top Secret Codebreaking Organisation That Cracked Enigma | Station X | Timelineというタイトルの動画です。
https://youtu.be/ddG9uev2c0U

解読のテクニカルな面ではなく、どのように解読結果が役立ったかを具体的に教えてくれます。Turingは解読プロセスにコンピュータの元祖ともいえる機械、Bombを開発しました。終戦前には200台ものBombが暗号解読に利用され、解読が機械の導入で流れ作業化されたそうです。その後、Station Xではコロッサスというコンピュータが開発されて暗号解読に利用されたそうです。

Rosalind Franklinの墓碑銘

彼女のお墓はロンドンにあるそうです。その墓碑銘にはDNAについては書かれていないのは衝撃的です。
https://historicengland.org.uk/listing/the-list/list-entry/1444176
こちらのtwitterから墓碑銘の写真を引用しておきます。

In my Genetics course- I show my students the tombstone of Rosalind Franklin- to show that even on her grave- her greatest contribution to mankind is ignored… pic.twitter.com/UOIgXMx9rN

— Michael Klutstein (@KlutsteinlbCARL) April 26, 2023

彼女については、こちらのtwitterアカウントをご覧ください。https://twitter.com/WomenScienceRFS
彼女のスナップショット写真や下のNatureの記事のpodcastのurlものっています。
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01443-w

4月25日は有名なDNAの二重らせん構造の発見の論文が提出されて70年の記念日だそうで、雑誌Natureにも記念のコメントがでていました。37歳の若さで癌で亡くなった彼女のDNAの構造解明への貢献は大きく、今回の記事でも正当に評価されているようです。
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01313-5
それを見た研究者がまた記事をあげています。興味深い記事ですのでご覧ください。
https://www.breakdowneducation.co.uk/post/structural-inequality-the-misogyny-behind-the-discovery-of-the-double-helix

2020年には英国で彼女の生誕100年を記念するコインも発行されていることもこの記事で知りました。買ってみたいですね。
https://www.royalmint.com/our-coins/events/rosalind-franklin/2020-uk-50p-brilliant-uncirculated-coin/

今日はちょっと忙しかったので本の紹介です。生気論というのをご存知ですか。発生学の教科書にでてくる有名な発生学者のハンス・ドリーシュ（Hans Driesch) は「生気論の歴史と理論」という本を書いています。彼の提唱したエンテレキーという概念を中心とした生気論は、この本を訳した米本昌平さんによると、科学界のみならず哲学界からも非科学的な妄説の提唱者として非難され続けたそうです。
米本氏によると、このドリーシュの本は20世紀が最も憎悪した書だそうです。この説について詳しくは米本昌平さんが訳された「生気論の歴史と理論」およびこの訳書中の米本氏による解説論文をご覧ください。https://honto.jp/netstore/pd-book_27211662.html
英語で書かれた生気論についての本でオープンアクセスでお勧めなのは2023年発行の次の本です。
Vitalism and Its Legacy in Twentieth Century Life Sciences and Philosophy （Springer, 2023)
https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-031-12604-8
ベルグソンやドリーシュの生気論、それ以降の発展について書かれています。リンクからpdf版やEPUB版の本がまるごと一冊ダウンロードできるほか、目次をみて読みたい章のみダウンロードすることもできるのでご覧ください。

Kindle本の安売り情報です。
ときどきKindleのセールがあるので、本を安く入手することができます。Amazonでは毎日、Kindle本の日替わりセールというのをやっていて、理系の本―特に講談社の本が多いです―が格安で入手できますので、チェックしてみてください。月替わりセールもあります。
https://www.amazon.co.jp/hko/deals/?_encoding=UTF8&ref_=sv_nav_ebook_6
例えば今日は、「ガウス過程と機械学習 (機械学習プロフェッショナルシリーズ) 」という単行本では3300円の本が、Kindle版では499円で売っています。アマゾンのポイントも250ポイントつくので、単行本が120ポイントで実質3180円で買えるところが、Kindle本では249円で買えることになります。日替わりセールの本は理系書籍の場合、数千円のものが500円程度で買えるので是非毎日チェックしてみてください。
あと、今はゴールデンウイークでいろいろKindle本のセールをやっています。講談社の本のKindle版は販売価格の半分のポイントがつくので実質半額セールになっています。理系の高額本や講談社文庫、ブルーバックス、現代新書などいろんな本が実質半額で買えるので以下のリンクで必要な本がリストにないかどうか探してみてください。https://t.co/cNnqf0ptwB

理系専門書はこちらからも探せます。https://t.co/APHXzReqEY

またKindle本のゴールデンウイークセールというのもやっていて、https://www.amazon.co.jp/b/ref=kc_dls_goldw_s&c_d?node=18502203051
こちらではたとえばこんな本が単行本定価の半額で買えます。この二冊は九大出身の先生が書かれた、場の量子論の名著だそうです。

場の量子論 －不変性と自由場を中心にして－ 量子力学選書 Kindle版
坂本 眞人 (著)
場の量子論（II）　ファインマン・グラフとくりこみを中心にして 量子力学選書 (2020/09/25)
坂本 眞人 (著)

日本でもヒトの糖鎖の全貌を解明する巨大プロジェクト「ヒューマングライコ―ムプロジェクト（Human Glycome Atlas Projyect (HGA)）」が文部科学省「大規模学術フロンティア促進事業」として始動しました。これは有名なすばる望遠鏡プロジェクトに匹敵する巨大プロジェクトです。5月15日に開催されるヒューマングライコームプロジェクト特別シンポジュウム2023への参加申し込みはこちらからどうぞ。
https://igcore.thers.ac.jp/news/495-2.html

ということで、これにちなんで今日は糖鎖生物学の英語ビデオを紹介します。Glycomics Institute of Alberta　(カナダのアルバータ大学）
https://glyco-alberta.ca/の次のビデオMystery of the Glycocode: The Secret Science of Sugars | Lara Mahal | GIA2022は
https://youtu.be/2LN7LuVxwF8

一般向けに糖鎖生物学が極めて重要な学問であること、病気の予防や治療など、様々な応用にも必須の分野であることをわかりやすく解説しています。糖鎖生物学に興味のある方向けの、英語の勉強にもなるかと思います。上記のサイトには、様々なビデオや教材がありますのでご覧ください。
たとえば、このサイトhttps://glyco-alberta.ca/の上部にあるResourcesをクリックすると、Educationalというメニューがあります。クリックすると、糖鎖生物学を学ぶのに役立つビデオや教材、外部リンクなどがまとめてあるページが開きますので、是非ご覧ください。
https://glyco-alberta.ca/educational-resources/
最初に紹介したビデオもありますし、その他の興味深いビデオもみられます。また教育者向けのリンク　For Educatorsをクリックすると、哺乳類の糖鎖を構成している代表的な単糖10種類のポスターもダウンロードできますよ。
http://glyco-alberta.ca/wp-content/uploads/sites/2/2023/04/10-Mammalian-Monosaccharides-GIA.pdf