The Nomura Institute of Glycosciece Blog

今日はカドヘリンを発見された竹市雅俊先生の新刊を紹介します。

「あつまる細胞　体づくりの謎」（岩波科学ライブラリー316）という本です。
https://www.iwanami.co.jp/book/b618302.html

この本は竹市先生が、カドヘリン発見のはげしい国際競争の過程やカドヘリン研究の現況、そして今後の展望をわかりやすくまとめられた本です。

竹市先生が2020年のカナダのガードナー国際賞（ガードCanada Gairdner International Award）を授賞された時は、オンラインの授賞式が行われ私も参加しました。竹市先生は高校の生物の教科書にものっているカルシュウム依存性細胞接着分子カドヘリンの発見で有名です。カドヘリンと相互作用する分子として同定されたβカテニンは、細胞接着以外に、Wnt（ウイントと読みます）シグナル伝達系の構成分子として転写因子としてDNAに結合することも判明し、私達の九大の発生生物学研究室（当時は山名清隆教授）のメインテーマであったアフリカツメガエルの背腹軸の形成の因子（具体的にはβカテニンの作用でアフリカツメガエルの背側構造が誘導されます）であることも衝撃的な発見でした（GumbinerやMoon、Kemler他）。先生は私が大学院生時代に属していた岡田節人教授の研究室で助教授をされていて、丁度私の在籍時はカドヘリンの研究がまさに花開く直前でした。それでカドヘリンの発見への試行錯誤の様子を、研究室内の研究進捗報告セミナーで逐一みせてもらうことができたのは幸いでした。

私が担当していた大学院の分子発生生物学特論の授業では、必ず竹市先生のカドヘリン発見のseminal paper (ある分野での画期的な、新しいパラダイムを導入するような論文）を学生さんに読んでもらって、カドヘリンの発見にいたる試行錯誤の様子を解説していました。今回出版されたこの本では、発見者みずからによる発見談に加えて、カドヘリン研究の現況、将来の展望、竹市先生の科学観なども学べるので、科学を学ぶすべての分野の学生、研究者におすすめできる本だと思います。是非読んでみてください。簡単なカドヘリンの発見談はこちらにすでに公開されています。http://www.cdb.riken.jp/ctp/cadherin.html

またこちらの生命誌研究館の記事「細胞から個体へ － 脇道から到達した発生生物学の本流」は、この本を買うかどうか迷っている方におすすめします。
https://brh.co.jp/s_library/interview/51/

プレプリントサーバーをみていて気づいた論文です。参考になるかもしれないので記事にしておきます。
データアナリシスの教科書でよくみかける誤りというのが列挙してあります。
“Six textbook mistakes in data analysis”
https://arxiv.org/abs/2209.09073
サイトから一部引用しておきます。
Authors: Alexandros Gezerlis, Martin Williams
Abstract: This article discusses a number of incorrect statements appearing in textbooks on data analysis, machine learning, or computational methods; the common theme in all these cases is the relevance and application of statistics to the study of scientific or engineering data; these mistakes are also quite prevalent in the research literature. Crucially, we do not address errors made by an individual au… ▽ More
このプレプリントはJournal ref: Eur. Phys. J. Plus 138, 19 (2023) に査読が終わって掲載されているようです。

またこちらには同じ著者による計算物理でよくみかける誤りが同じく6つ列挙されています。
著者は計算物理の教科書　Numerical methods in physics with Python　（ケンブリッジ大学出版会）を書いている人です。
https://numphyspy.org/
2020年の本ですが、今年2023年に第二版がCambridge University Pressからでるそうです。
“Six textbook mistakes in computational physics”
https://arxiv.org/abs/2006.08592
Authors: Alexandros Gezerlis, Martin Williams
Abstract: This article discusses several erroneous claims which appear in textbooks on numerical methods and computational physics. These are not typos or mistakes an individual author has made, but widespread misconceptions. In an attempt to stop these issues from further propagating, we discuss them here, along with some background comments. In each case, we also provide a correction, which is aimed at su… ▽ More
このプレプリントはAm. J. Phys. 89, 51 (2021) に査読済み論文として掲載されています。

国立国会図書館の個人送信資料にこんな本を見つけました。
人間の発見と創造 : 21世紀への教育の提言 (講談社現代新書)
ブロノフスキー 著 https://dl.ndl.go.jp/pid/1381618
この本は、講談社現代新書の一冊です。Amazonでは中古で17000円以上の価格がついていてびっくりしましたが、個人送信資料で無料で読める（ネットでの国立国会図書館への登録が利用には必要です）のはありがたいです。この本はC.P.Snow、Julian Huxley、Norbert Wienerなどの超有名人が推薦文を書いてる本です。
原書はScience and Human valuesというタイトルで、著者Jacob Bronowski(1908-1974)が教授をつとめていたMITで実施した講演をまとめた本です。著者はポーランド生まれでイギリスに帰化した数学者・統計学者。第二次世界大戦ではOR（オペレーションズ・リサーチ）を駆使してドイツや日本への爆撃その他の戦略の効果を調べていたそうです。彼の軍務の一環として、広島・長崎への原子爆弾投下後の被害調査に来日しており、この本はその体験から生まれたと本のはじめのほうに書かれています。現代の私達が今、もう一度読んでみる価値のある本だと思い、紹介することにしました。

訳書には日本の読者のための序文も入っています。改訂増補版が出版されており新たに　The Abacus and the Rose-A New Dialogue on Two World Systemという章が追加されています。https://archive.org/details/sciencehumanvalu00jaco/mode/2up
著者はイギリス石炭庁の研究所長をつとめたり、人類学を研究したりと科学者としても多才ですが、BBCの科学・文化解説でも著名で、多くの本を書いています。Internet Archiveでこの著者の本を借りることができますのでご覧ください。国立国会図書館の個人送信資料にも次の様な本が登録されており、読むことができます。この著者の本のタイトルはポアンカレとかダーウィンとか、ガリレオとかの本のタイトルにちなんだものが多いと思われるのではないでしょうか。

科学とは何か : 科学の共通感覚 (みすず科学ライブラリー)
https://dl.ndl.go.jp/pid/2422310/1/120

原子の伝記 (福音館の科学シリーズ ; 3)
https://dl.ndl.go.jp/pid/1655462」

日本の古本屋https://www.kosho.or.jp/などで探せば他のさまざまな本も見つかると思います。こちらは妥当な値段がついています。

Internet Archiveでは彼のBBCの番組もみられます。

昨日はTuring の反応拡散系について書きました。
Mathematicaでもモデリングできますと書きましたが、それについて書いてある本でお勧めは九州大学医学部の三浦岳先生の「発生の数理」（京都大学出版会）という本です。https://www.kyoto-up.or.jp/books/9784876988877.html
京大出版会のサイトをみてもらうと目次がありますが、Mathematicaの使い方からはじまって、具体的な発生の数理モデルの作り方を懇切丁寧に書きこんである、他では得られない良い本です。一番のおすすめです。Mathematicaのコードは、自分で打ち込むのが良いと思います。先生のホームページ（本に書いてあるurlは変わってしまってリンク切れになっていますので注意してください。最新の先生のサイトはこちらです。
http://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/
このホームページにこの教科書のMathematicaのコードがのっているはずですが、私の探し方が悪いのかみつけられませんでした。先生の研究室のホームページにある関連のMathematica notebookはこちらからみられます。
https://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/technical/Mathematica/
先生のサイトの技術情報のページ
https://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/technical/
には様々な有用な情報があるのでご覧ください。以下の部分は先生が訂正してくださったので打消し線をいれておきます。
からそこにあるMathematicaやRなどの項目へのリンクは機能していません。これは旧いサイトのurl（http://anat1.wp.med.kyushu-u.ac.jp/technical/で始まるurl）を使っているためリンク切れになっていているのです。http://anat1.wp.med.kyushu-u.ac.jp/technical/Mathematica/などとなっているリンクをhttps://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/technical/Mathematica/のように修正すると正しく表示されます。
まとめると、（http://anat1.wp.med.kyushu-u.ac.jp/technical/)の部分を新しいサイトのurlである https://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/technical/に修正してアクセスしてみてください。

先生のサイトにある研究内容にある先生の記事は一読の価値のあるご意見だと思います。。私も発生生物学を研究しておりましたので、同感です。
https://www.lab.med.kyushu-u.ac.jp/anat1/research/