ワシントン・ポトマック河畔の桜並木は高峰譲吉博士によって贈られた桜がそのはじまりです。

今日は日本の有名な科学者 高峰譲吉博士の映画2本を紹介します。よい映画でAmazon Prime Videoでも両方とも見られますので是非ご覧ください。

桜が散り始めている今日この頃ですが、先日NHKニュースでワシントンの桜並木をつくった女性の話がありました。ポトマック川の河畔の桜並木は、昔日本から寄贈されたものです。有名な日本の科学者 高峰譲吉博士がかかわっているのは有名です。こちらのサイトに桜がいかにしてワシントンのポトマック河畔に植えられたかが詳細に書かれています。ヘレン・タフトさん(アメリカ大統領夫人)とエライザ・R・シッドモア女史、そして高峰譲吉博士の三人がいかにしてポトマック川べりに桜を植えることになったかが詳しく書かれていてなるほどと納得できます。
https://npo-takamine.org/who_is_takaminejokichi/private_diplomacy/sakura/

高峰博士の生涯と桜の寄贈の話は映画化されています。「さくら さくら」という映画と「TAKAMINE」という映画の2本で、DVD化されており両方の映画を収録したDVDパッケージを購入することができます(私は2013年頃に買いました)。最初に書いたように、Amazon Prime Videoでは、どちらの映画も観ることができるので、契約している方は是非ご覧ください。予告編を並べておきます。
https://youtu.be/gM-kaVxtR7w

https://youtu.be/8ifFBTSAZoE

高峰博士は理化学研究所の創設の提唱者であり、製薬会社の三共(現在の第一三共)の創設者、ベークライトの国産化会社(現在の住友ベークライト)の創立、酵素事業の先駆けであるタカジアスターゼの開発製品化、世界初のアドレナリンの抽出、結晶化と製品化などなど、多彩な業績をもつ科学者、実業家です。映画はわかりやすくその生涯と業績をまとめていますので、是非ご覧になることをおすすめします。
高峰博士については、高峰譲吉博士研究会のこちらのサイトで詳しく学ぶことができます。
https://npo-takamine.org/

映画Takamineの主題歌は白井貴子さんが歌っており、映画にも北里柴三郎の妻の役で出演されているそうです。
https://tvfan.kyodo.co.jp/news/3841

ブラックホールを撮影する―という動画の紹介です。

おなじみの英国Royal InstutionのYouTubeチャンネルにの最新の動画に、How to photograph a black hole – with Ziri Younsiという講演がアップロードされています。https://youtu.be/fGGW-kwc2n0

この動画では、ブラックホールの人類初の撮影に成功したイギリスチームのメンバーが、ブラックホールは何か、どのように見えるのか、どのように撮影するのかなどをわかりやすく解説してくれています。講演の中で映画インターステラ―の描くブラックホールに間違いがある(ブラックホールの回転にともなうドップラー効果を映画では考慮していない)という面白い話もあります。この講演を見た後、Interstellarの映画のブラックホールの描写で間違っているところはどこでしょうと、ChatGPT-4にきいてみました。
映画について詳しく教えてくれた後にこんな答えが返ってきました。結構ちゃんとした答えだと感心しました。詳しくは上の講演を聞いてみてください。
Some possible inaccuracies in the Interstellar depiction include:

1.Accretion disk brightness: The brightness and distribution of the light surrounding the black hole in Interstellar might be different from what we observed in the M87 black hole image. The accretion disk in the movie is depicted as being quite bright and uniform, while the real image shows an uneven brightness distribution.

2.Warping of light: While Interstellar did an impressive job visualizing the gravitational lensing effect of a black hole, the real image of the M87 black hole showed an even more dramatic warping of light around it. This is due to the immense gravity of the black hole bending the light from the accretion disk.

These discrepancies can be attributed to artistic liberties taken by the filmmakers and the fact that the real image of a black hole was not available during the production of Interstellar. Despite these differences, Interstellar’s Gargantua remains one of the most scientifically accurate representations of a black hole in popular media.

パワーポイントで図を作る方法の動画を紹介します。

今日は、パワーポイントで図を作る方法についての動画のお話です。
パワーポイントで図を作るのは、イラストレーターなどを使うよりずっと手軽です。作り方の参考になる動画をいくつか紹介します。

以前紹介した早稲田大学の早水先生の動画はパワポの基礎を教えて下さる良い動画ですのでまず見ることをお勧めします。
https://www.youtube.com/playlist?list=PLCo60G1m_ibpf1tnAnTX5yNJh7rZPk4p6

早水先生の動画でパワポの使い方がつかめたら、自分で図を作ってみましょう。一からつくるのは大変ですので、すでにできている図をもとにして作ってみるのがお勧めです。こうした図の作り方については英語ですがこちらなどは参考になります。動画では英語版のパワポを使っているので日本版とちがってとまどいます。でもこういうことをする方法があるのだと動画でわかれば、Google検索で日本語で動画の操作のやり方を調べて、日本版のパワポで使うのは簡単です。是非やってみてください。
https://youtu.be/rAznt5I2nhs

この動画がのっているチャンネルはこちらです。もっといろんなパワポの使い方がわかります。
https://www.youtube.com/@scienceinfographics4175/videos
https://www.youtube.com/playlist?list=PLaX2vrGncQxhg79Iz5mlXCA22_-HD6hny

データの可視化や強化学習についての無料の教科書(英語版)を3冊紹介します。

データ可視化や強化学習の英語無料本を3冊紹介します。初めの2冊は O’Reillyから出ている本です。
1)Hands-On Data Visualization–Interactive Storytelling from Spreadsheets to Code
Jack Dougherty and Ilya Ilyankou (2023-03-07)
これは紙の本は有料ですがオンラインで無料で読めます。。
https://handsondataviz.org/index.html
最新のスプレッドシート(エクセルではなくてGoogle sheetsやLibreOffice Calcそのほかのソフトを使う最新のデータ可視化の手引き書です。Google Sheets, Datawrapper, Tableau Publicなどの使い方から、Chart.js, Highcharts, Leaflet on GitHubなどでのコードの仕方など、自分のデータを可視化して皆にみせて話の流れをつくって、それを語る、そのやり方の手引き書になっているそうです。プログラミングの経験不要ということですので面白い本だと思います。

2)またデータの可視化については、こちらの本もあります。これは以前の記事で紹介した本です(末尾に該当記事をコピペしておきます)。これは、読んですぐに研究発表に使える本です。学生や研究者が研究発表するときに必須の参考書で、是非持っておきたい本ですね。
Fundamentals of Data Visualization
Claus O. Wilke
https://clauswilke.com/dataviz/

3)最後に強化学習の教科書も無料で読めますし、スライドやpdfをダウンロードすることもできます。
Reinforcement Learning: An Introduction written by Richard S. Sutton & Andrew G. Barto
Second Edition (MIT Press, Cambridge, MA, 2018)
http://incompleteideas.net/book/the-book-2nd.html
2025/3/06追記:著者二人は強化学習のパイオニアで、2024年のTuring賞を受賞しました!

以下は以前の記事の再掲です。
2022/1/11
英語の本ですが図の作り方についての良い本Fundamentals of Data Visualizationがありました。クリックして読んでみてください。とても参考になる内容です。また以下の記事は手っ取り早く良い図の作成について理解できるので有名です。Ten simple rules for better figures (PLOS computational biology 2014) 

ChatGPTの教科書が公開されています。

ChatGPTの教科書がnoteで公開されています。初心者むけの内容ですが、プログラムをつくってもらうのにはどうするかなども書いてあるので役立つと思います。https://note.com/programdiy/n/nc2f9566ac615

ChatGPTの始め方については、この教科書にある以下のリンクにある動画が役立つと思います。

https://www.youtube.com/@ChatGPTResearch/featured
以前のこのブログの記事もご覧ください。

ChatGPTの使い方についての良い動画を紹介します。またChatGPT Plusでのオプトアウトをやってみました。

写真は数日前の我が家の庭です。春の花がずいぶん咲いています。種から育てたストックや、桜の花の下に咲いていた原種水仙もきれいに咲きました。

臓器移植(同種、異種移植)と動物福祉について理解するための最高の本がでています。

今日は「異種移植 医療は種の境界を越えられるか」(山内一也著、みすず書房2022)という本を紹介します。https://www.msz.co.jp/book/detail/09528/
本の帯にはこうあります―「動物の臓器を人に移植する。その挑戦は、超急性拒絶反応や未知のウイルス感染症の出現リスクなどの難題に何度も阻まれてきた。新技術の到達点を展望する書。」

この本は、ヒヒの心臓を新生児に移植した手術 (失敗に終わりました)の話からはじまり、同種移植の歴史(ヒトでの心臓移植などの話)、異種移植の話 (ドナー不足を補うなどの目的で、ヒトの心臓のかわりにブタの心臓を移植するなどの例もとりあげられています)、その実施にともなう拒絶反応(ブタの細胞表面の糖鎖にはヒトにはない糖鎖修飾であるα 1,3ガラクトース修飾があるため拒絶反応がおこります)をおこさないブタの作成、ブタのもつウイルスへの対処法の開発、クローンブタの作成と臓器工場として異種生物を使う可能性の話、パーキンソン氏病への治療法としての脳組織移植の実例、などなどしっかりとした解説で、臓器移植についての理解を格段に深めてくれる本となっています。また動物福祉の考え方と現在の科学界の対応についても、とてもわかりやすく解説してあって、以前このブログでも紹介した3Rについても多分一番わかりやすく解説されていると思います。是非読んでもらいたい本で心からお勧めします。Kindle版もありますのでそちらもおすすめです。

今日は満開の桜見物にでかけました。ChatGPTについての資料の紹介もあります。

今日は桜見物にでかけました。写真は近所の風景です。桜の木のしたにナルキッスス・バルボコディウムという原種水仙がいっぱい咲いていてとても綺麗でした。
https://www.shuminoengei.jp/m-pc/a-page_p_detail/target_plant_code-101

桜はほぼ満開です。宇美神宮にもいきましたが、子供たちがいっぱ遊んでいて、さすが子供の神社といわれるだけありました。左の写真は宇美八幡宮のシンボルで、あまりに大きいので一本の木なのに「湯蓋(ゆぶた)の森」といわれる樹齢2000年という話もある国天然記念物のクスノキです。

赤ちゃんをだきかかえたお母さんとお父さんがそろってこの木の前で写真をとったりしている様子はとても幸せそうでした。先日、万葉百科というサイトを紹介しましたが、そこで万葉歌碑を検索すると宇美八幡宮にもあるようです。
https://kofunmeguriwalking.web.fc2.com/8_7_U01_umihachimanguu.html
銀も金も玉も何せむに優れる宝子にしかめやも
(しろかねもくがねもたまもなにせむにまされるたからこにしかめやも)という、
山上憶良(やまのうへのおくら)の有名な歌の歌碑です。この歌は私は学校の古典の時間に習いました。

さて、今日もChatGPT関連の話題です。
ChatGPTはとても役立つツールだと思います。東京大学の工学系研究科 技術経営戦略学専攻 松尾研究室の今井翔太さんが、ChatGPTについてのわかりやすい資料を公開してくださっています。
以前に今井さんがslideshareに公開されていた資料は、以前は簡単に閲覧できたのですが、今は数枚スライドをみていると広告がはいって閲覧が中断されたり、ダウンロードに認証がいったりと極めて利用しにくくなったので、slideshare離れが起こってしまったようです。今日のtwitterによると、スライドを追加するなどして、Speakerdeckのほうにアップロードしてくださったようです。これは本当に助かります。
https://speakerdeck.com/imai_eruel/chatgpt-imai

またChatGPTとの対話の様子を詳しく紹介している以下の記事(高木浩光@自宅の日記の2023年03月27日の記事)
「■ OECDガイドラインの8原則についてChatGPTに聞いてみた」もとても参考になります。実際にAIと対話する様子とそのテクニックがよくわかります。ChatGPTとの対話では、マスコミにでてくる有識者と対話するよりもずっと、実のある意見がきけそうです。
http://takagi-hiromitsu.jp/diary/20230327.html#p01

ベイズ統計学の「院生、研究者むけ」のよい教科書があるそうです。

ベイズ統計学の大学院レベルの教科書で、このごろ話題になっている本に
Statistical Rethinkingという本があります。これは自分で手をうごかして統計学を学ぶための教科書で、統計学を学校で学ばなかったけれど、なんとなく使っている私のような人間に最適の教科書のようです。Rを活用して学べる本です。ドイツのライプチヒにあるマックスプランク研究所のRichard McElreath先生が書いた教科書で。先生は進化人類学者で、Department of Human Behavior, Ecology, and Culture、Max Planck Institute for Evolutionary AnthropologyのDirectorです。
本のサイトはこちらです。

https://xcelab.net/rm/statistical-rethinking/
対象とする読者は回帰分析などを学んでいるが、統計学でのモデルの扱いに いまいち自信が持てない大学院生や研究者だそうです。すでに第二版がでていて著者は第三版の用意もしているようです。YouTubeにこの教科書を使った講義が全部公開されているので興味のある方はみてみるとよいでしょう。2023年の講義が丁度おわったところだそうです。
https://www.youtube.com/playlist?list=PLDcUM9US4XdPz-KxHM4XHt7uUVGWWVSus

githubの講義サイトはこちら。
https://github.com/rmcelreath/stat_rethinking_2023

高校生向けの冬休み講座(東京大学)が面白そうです。

いろんな大学で高校生、中学生むきの講座をおこなってYouTubeなどに公開しているようです。今回は、東京大学の公開講座、
高校生のための冬休み講座2022 Onlineから 「非平衡状態で物質の”限界”を超える」というタイトルの、高三和晃(たかさん かずあき)先生による講演を紹介しておきます。高三先生のtwitterはこちらです。https://twitter.com/takasan_san_san
残念ながら講義の冒頭のほうでおっしゃっている参加者用資料の公開は終わっていてダウンロードできないようですが、講義だけでも楽しめると思います。是非YouTubeのサイトにダウンロードリンクを載せてもらってダウンロードできるようにしていただきたいと思います。
https://youtu.be/uCHSf5fUAaA

面白そうな講義なので私も時間ができたら勉強させてもらおうと楽しみにしています。
量子力学の話からはじまって、統計力学、非平衡状態の話などが続きます。時間結晶とか生物が非平衡であること、スピンと鳥の群れの関係などなど、生物科学に興味がある人にもおすすめの内容です。是非ご覧ください。

同時に行われた次の講義も面白そうです。

高校生のための冬休み講座2022 Online 「√1 はいつでも1か?」岩木耕平先生
https://youtu.be/RZAHjYlmKBg

BMP (骨形成因子/骨形成タンパク質)について てっとりばやく知ることができる動画があります。

BMP (bone morphogenetic protein)というタンパク質をご存知ですか?
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/%E9%AA%A8%E5%BD%A2%E6%88%90%E5%9B%A0%E5%AD%90
これは骨をつくるときに重要な役割をはたすということで骨形成因子とか、骨形成蛋白質とよばれている有名な分子です。骨形成を誘導、促進する分子であることから始めは骨粗鬆症の予防や治療のてがかりになると注目されていた分子です。ところが日本の上野直人先生たちの研究によって、この分子が脊椎動物のオーガナイザーの形成に決定的な役割をはたしていることがわかりました。私も発生生物学や分子発生学の講義でBMPやアクチビンの役割を教えていたのですが、最近の発展については勉強不足です。それを補うような講演がおなじみのNIH video castで行われていたので紹介します。てっとりばやくBMPについて学ぶのには最適の動画です。

いつものようにこちらのサイトにアクセスして、ダウンロードリンクから動画を高画質でダウンロードできます。
https://videocast.nih.gov/Summary.asp?file=33055
字幕のダウンロードもできますので字幕がよみこめるmedia playerで字幕を読み込ませて動画をみることもできます。
ダウンロードの
やり方は簡単です。左下にある+Moreのボタンを押すと、Downloadボタンがでてきます。クリックするとselect bitrateのボタンがでます。それを押して好きな画質(最高画質は1840k)を選んでダウンロードしてください。Captionをダウンロードするボタンもありますのでそちらから字幕をダウンロードできます。

この講演はYouTubeでも公開されています。そちらで視聴することもできますし、その場合Chromeの機能拡張Language Reactorを使えば自動で字幕表示しながらわからない単語は辞書をひきひき見ることもできるので便利です。https://youtu.be/DIptTFoIs4g