カテゴリー: linux

分子動力学のソフトであるGROMACS というのをご存知ですか？

投稿日: 2023年10月3日投稿者: root

GROMACSは。”A free and open-source software suite for high-performance molecular dynamics and output analy…

投稿日: 2023年9月30日投稿者: root

講談社のブルーバックスの本をKindle unlimitedでいろいろ借りて読んでいます。以前紹介した「分子レベルで見た薬の働き」、「分子レベルで見た体の働き」という平山令明先生の本では、本文でとりあげられているタンパク…

投稿日: 2023年9月25日投稿者: root

AmazonのKindle unlimitedに大量のブルーバックスが入っているのを以前紹介しました。こちらのAmazonのツイートによると10/31終了予定とのことです。【Kindle Unlimited】創刊6…

投稿日: 2023年9月24日投稿者: root

無事に京都から戻ってきました。福岡も数日前よりもずいぶん涼しくなっていて快晴でした。京都も今日は快晴で、朝はやくから京都駅の近くにある東本願寺の飛地境内地の庭園である渉成園（しょうせいえん）を見に行きました。 https…

投稿日: 2023年9月23日投稿者: root

約一年ぶりに京都にきています。昨年はコロナで人出が少なかったですが、今年は外国人観光客も激増していて賑わいがもどったようです。和服をきて歩いている外国人観光客がとても多いです。またホテルのスタッフもマスク着用は任意になっ…

投稿日: 2023年9月11日投稿者: root

自宅のメインPCが故障してしまったので、新しいPCに故障したPCのデータを移動しています。メインの内蔵HDDドライブを取り出して、HDDスタンドにたててUSB接続で新PCにつないで中身を回収中です。今日は旧PCで使っ…

投稿日: 2023年8月24日投稿者: root

昨日紹介したGitHubにあるオンラインで読める化学や生命科学の学生のための数学の教科書”Applying Maths in the Chemical & Biomolecular Sciences …

投稿日: 2023年8月7日投稿者: root

PyMOLでは、PDBのサイトにあるタンパク質なら、登録番号をいれるだけで一発で立体構造を表示できます。しかし、AlphaFold2で予測されたpdbファイルはPDB のサイトにはないので、AlphaFold　Prot…

投稿日: 2023年7月17日投稿者: root

MRC LMBのバイオインフォマティクス入門ビデオの紹介です。これはバイオインフォマティクスを鳥瞰図的に紹介してどんなツールやデータベースがあるか、バイオインフォマティクスを使いこなすには何を学べばいいのかを紹介するT…

生物学者のためのR入門の英語サイトがあります。カナダのQueen’s Universityの研究者のサイトです。 https://colauttilab.github.io/RCrashCourse/1_fu…