The Nomura Institute of Glycosciece Blog

野村一也　「科学を学ぶ人のために」　九大野村研ホームページの拡張版です

ランサムウエア感染の事案報告書を読みました。これはセキュリティ対策にとても役立つと思うので紹介します。

投稿日: 投稿者: root

インターネットのセキュリティについてとても勉強になる報告書が公開されています。奥村先生のツイートで知りました。

岡山県の病院でランサムウエアを仕込まれて電子カルテのデータなどを暗号化されてしまった事件があったそうです。その報告書が公開されました。
https://www.popmc.jp/home/consultation/er9dkox7/lromw3x9/

病院のネットワーク自体は外部との接続がない閉鎖的なネットワークで安全なはずだったのですが、コロナ禍でVPNでネットワークを保守するようになった際、　VPN装置の脆弱性の保守ができておらず、接続してくる相手のIPアドレス制限もなされていなかったため全世界からVPNにアクセスできる状態だったそうです。こうしてVPNを通じて世界のどこからでも病院の閉鎖ネットワークを攻撃できる状態だったのですが、悪いことに管理者ログイン名とパスワードがadministrator/P@ssw0rdという安易なものであったこと、利用者全員に管理者権限を与える設定にしていたことなどが原因で、犯人に侵入されたようです。病院のネットワークに侵入した犯人は手動でウイルス対策ソフトを無効化するなどして、本来ならウイルスソフトで検出できるはずのランサムウエアを使ってデータを暗号化したようです。

よくニュースで聞くランサムウエアというのがどんなものか、どのように感染してどのようにそれを防げるのかなどが実例をもとにわかりやすく書かれている報告書です。大変参考になるよい報告書ですので是非一度は読んでみるべきだと思いました。

地方独立行政法人　岡山県精神科医療センター　ランサムウェア事案調査報告書について

国立国会図書館デジタルコレクションで読める本の紹介（第22回）

投稿日: 投稿者: root

ちょっと忙しいので国立国会図書館デジタルコレクションで読める本のリストを追加しておきます。(番号は通算何冊目の紹介化を示しています）
今日は数学史や化学史、科学史関係の本で、個人送信サービスで読めるものの一部を紹介します。
このところ、出版社の復刊ブームのようで、デジタルコレクションで読めていたものが読めなくなる例がいくつかあります。過去記事で紹介した甘利先生の本とか、「ガロアの夢」とかが、残念ながら読めなくなってしまいました　(過去記事の該当箇所に注記してあります）。

まずは古典で、『現代数学の系譜』シリーズ5冊を挙げます。
228)　ラプラス 著 ほか『確率論 : 確率の解析的理論』,共立出版,1986.12. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12622756 (参照 2025-02-13)
1812年の本です。確率論の発展についての解説もついています。

229)　コーシー 著 ほか『微分積分学要論』,共立出版,1969. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12622342 (参照 2025-02-13)
1823年の本の小堀憲先生による翻訳です。解説もついています。

230)　G.カントル 著 ほか『超限集合論』,共立出版,1979.9. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12608434 (参照 2025-02-13)
集合論のカントルの論文（1895-1897）の翻訳と解説が読めます。

231)　ポアンカレ 著 ほか『常微分方程式 : -天体力学の新しい方法-』,共立出版,1970. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12623533 (参照 2025-02-13)
ポアンカレの有名な本の第三巻（1899年）の全訳および第一巻の初めの部分の翻訳がついている本。大変難解と序文に書いてあります。解説付き。

232)　ヒルベルト 著 ほか『数学の問題』,共立出版,1969. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12608395 (参照 2025-02-13)
ヒルベルトの「数学の問題」（1900年）という講演の全訳。英語に翻訳された本はこちらから読めます。https://www.gutenberg.org/ebooks/71655

233)   ヒルベルト 著 ほか『幾何学基礎論』,弘文堂書房,昭和18. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/1063372 (参照 2025-02-13)　日本語ではこの本が1969年に復刊されてました。手元にありますがこのデジタルコレクションの本とまったく同じ内容です。英語へ翻訳された本はこちらから読めます。https://www.gutenberg.org/ebooks/17384
しかし日本語版のほうには、関連論文と講演および日本語での解説も収録されているので日本語版がおすすめです。

化学の歴史の本で以前紹介した『化学史伝』の著者　山岡望先生の本は読みやすいエピソード満載の本です。
234)  山岡望 著『化学史塵』,内田老鶴圃新社,1978.6. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12712441 (参照 2025-02-13)

235)  山岡望 著『化学史筆』,内田老鶴圃新社,1976. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12690802 (参照 2025-02-13)

236)  山岡望 著『化学史塵』,内田老鶴圃新社,1978.6. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12712441 (参照 2025-02-13)

次の本は、光合成の研究や酵素、ホルモン、ビタミンなどの研究史を含め、生化学の歴史全般を概観するのに最適の本です。
生命科学系の人には面白いと思われる生化学の歴史の解説になっています。
237) ジョゼフ・ニーダム 編 ほか『生化学の歴史』,みすず書房,1978.5. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12604685 (参照 2025-02-13)　

また次の二冊は、楽しんで読める科学史の本です。

238)  東京工業大学科学史ゼミナール 編『英文で読む大科学者のことば』1,講談社,1985.4.. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12590347 (参照 2025-02-13)

239)  東京工業大学科学史ゼミナール 編『英文で読む大科学者のことば』2,講談社,1985.4.. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12590348 (参照 2025-02-13)

有名なバナールの書いた1900年までの物理学史の本も面白そうです。
240）  J.D.バナール 著 ほか『人間の拡張 : 物理学史講義』,みすず書房,1976. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12621755 (参照 2025-02-13)　1900年以前の物理学史。

以下は本格的な化学史のようです。現代とありますが1964年の本ですからそのつもりで読まないといけません。
241)  アーロン・J.アイド 著 ほか『現代化学史』1 (基礎理論の時代),みすず書房,1972. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12690817 (参照 2025-02-13)

242)  アーロン・J.アイド 著 ほか『現代化学史』2 (専門への分化),みすず書房,1973. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12690816 (参照 2025-02-13)

243)  アーロン・J.アイド 著 ほか『現代化学史』3 (電子の世紀),みすず書房,1977.2. 国立国会図書館デジタルコレクション https://dl.ndl.go.jp/pid/12690815 (参照 2025-02-13)

オンラインの無料数学辞典の紹介。Wolfram Mathworldというサイトです。

投稿日: 投稿者: root

こちらはWolfram alphaやMathematicaでおなじみのWolfram 社が提供している無料のオンラインサービスMath Worldのサイトです。
https://mathworld.wolfram.com/

CRC Concise Encyclopedia of Mathematicsという有名な数学辞典の著者 Eric W. Weissteinによるこの紙の本の辞書の「オンライン版」です。紙の本より項目数が多く、かつ頻繁に改訂、項目の追加も行われているのでおすすめの辞書です。項目をクリックすると解説が読めます。Wolfram言語によるデモンストレーション付きの解説もあるので大変便利な無料サイトです。
簡単な英語で書かれていますので、興味のある項目をいろいろ調べてみるのもよいと思います。解説ページにはWolframAlphaの入力窓もついているので、解説を読んだり、リンクをたどったりWolframAlphaでしらべたり(日本語可）して勉強に役立ててください。WolframAlphaの入門にも使えそうです。

Proteopediaという生体分子の三次元構造を学べるサイトは秀逸です！

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Proteopediaは主にタンパク質の三次元構造をあつかっていますが、糖の立体構造とかも見ることができるサイトです。
https://proteopedia.org/wiki/index.php/Main_Page
中にはタンパク質の三次元構造を調べる方法（実験的に解明されている構造をまず探して、だめならAlphaFold2で調べるなどの具体的なやりかた、結果の見方も学べます）が詳しく解説されているページHow to Find a protein’s best structure
https://proteopedia.org/wiki/index.php/How_To_Find_A_Structure
もありますし、糖の立体構造異性体を分子模型を手でさわりながら学べるページもあります。

 

どんな内容がこのサイトにあるのかは、次の目次でみるとよいでしょう。
https://proteopedia.org/wiki/index.php/Proteopedia:Table_of_Contents
上のアニメーションは、サイトで表示されるMaltose（マルトース）とO-GlcNAc transferase(おーグルクナックトランスフェラーゼ）をGIFにして埋め込んだものです。元のサイトでは分子を自由に回転させてみることができるので是非試してみてください。
マルトースの場合、
https://proteopedia.org/wiki/index.php/Carbohydrates_II
にいってMaltoseをクリックすると立体構造が表示されます。
またO-GlcNAC transferaseはこちらから立体表示できます。
https://proteopedia.org/wiki/index.php/Human_O-GlcNAc_transferase
本格的に生体分子の立体構造を学ぶのに役立つサイトですので、活用できそうです。

数学版―今日は何の日？　数学の歴史に関する素晴らしいサイトMacTutorの紹介です

投稿日: 投稿者: root

今日は数学の歴史を探索できる良いサイトの紹介です。
MacTutor というサイトは、サイトの説明によると、世界の数学者3000人以上の生涯や、2000以上のエッセイ、その他　数学者の切手とかポスターもみられます。数学版の今日は何の日のコーナーもあって、楽しめるサイトです。
MacTutor is a free online resource containing biographies of more than 3000 mathematicians and over 2000 essays and other supporting materials. MacTutor is constantly expanding and developing.
MacTutor Indexのページから使ってみてください。https://mathshistory.st-andrews.ac.uk/

このサイトにある、数学版今日は何の日はこちら。https://mathshistory.st-andrews.ac.uk/OfTheDay/today/
2月10日は、ハレー彗星で有名な英国のハレーが王立天文台長になった日だそうです。以下はサイトからの引用です。
『On this day in 1720, Edmund Halley was appointed second Astronomer Royal of England. Halley succeeded John Flamsteed as Astronomer Royal, and he would hold the position until his death in 1742 at the age of 85.
See THIS LINK.』

同じページに2月10日は日本の数学者　会田 安明の誕生日だとでています。日本の和算家ですが日本の暦での2月10日生まれをそのまま使っているようです。この日に生まれた人、亡くなった人のリストもありますし、一日一言の数学者の言葉も載っています。今日の言葉はソフィア・コワレフスカヤの言葉でした。https://mathshistory.st-andrews.ac.uk/Miller/images0/kovalevskaya1.jpg

It is impossible to be a mathematician without being a poet in soul.

彼女の画像とかものっています。https://mathshistory.st-andrews.ac.uk/Biographies/Kovalevskaya/pictdisplay/

数学者の切手はこちらのページにまとまっています。1600以上の切手があつめられていて国別でもみることができたりします。
https://mathshistory.st-andrews.ac.uk/Miller/stamps/
他にも女性数学者のページとか国別の数学者の一覧などいろいろあるので、楽しめます。

医学英語の書き方、植物学の教科書、実解析や数学論理の教科書などが全部無料で読めます！

投稿日: 投稿者: root

アメリカの名門校SUNY(ニューヨーク州立大学）が無料で読める多くの本を公開しています。

Miline Open Textbook というサイトでSUNYのメンバー（いろいろ分校があります）が書いて査読した教科書を公開しているので、無料で読んだりダウンロードしたりすることができます。
https://milneopentextbooks.org/
サイトを開くとAvoiding Common Pitfalls in Medical Writing: An Editor’s Advice
Author(s): Deanna Erin Conners
という本が載っています。これは生命科学系の論文を書くためにとても役立つ学生・研究者必携の短い本です。
この短い本を勉強すれば、英語で論文を自分で書けるという自信がつくのではないでしょうか。
学部生、院生、研究者におすすめの、最新の論文の書き方の指南書です。
https://milneopentextbooks.org/avoiding-common-pitfalls-in-medical-writing/
さらに、論文を書くときに役立つ最新のインターネットサイトへのリンクも紹介されているのも素晴らしいところです。
たとえばこんなサイトも掲載されているリンクをたどると見つけることができました。
https://writingcenter.unc.edu/tips-and-tools/
これは英語でものを書くときに、ものすごく役立つサイトだと思うので是非　こちらも訪れてみてください。

Miline Open Textbookには他にこんな本もありました。
Inanimate Life
Author(s): George M. Briggs
https://milneopentextbooks.org/inanimate-life/
これは植物学の教科書です。動物ではない生命というようなタイトルで、カラー図版が満載で、わかりやすく植物学と関係する微生物について学べる教科書（800ページ以上あります）です。こんなのが公開されているのは素晴らしいですね。

こちらは数学の教科書です。
How We Got from There to Here: A Story of Real Analysis
Author(s): Eugene Boman and Robert Rogers
https://milneopentextbooks.org/how-we-got-from-there-to-here-a-story-of-real-analysis/
実数の微積分学の基礎を歴史をたどりながら紹介している本で、オンラインで読むこともできます。

A Friendly Introduction to Mathematical Logic
Author(s): Christopher Leary and Lars Kristiansen
https://milneopentextbooks.org/a-friendly-introduction-to-mathematical-logic/
これは数学で使う「論理」の多分もっともやさしい解説ではないでしょうか。数学の本や論文にでてくる不思議な記号の解説からはじまって、ゲーデルの不完全性定理までカバーしています。

数理モデリングの基礎が学べる本で、力学系の入門、差分方程式や微分方程式でのモデリングなどが初心者向けにやさしく書かれている教科書もありました。これはわかりやすそうです。書評でも高評価されている教科書です。著者は佐山 弘樹　先生です。

Introduction to the Modeling and Analysis of Complex Systems
Author(s): Hiroki Sayama
https://milneopentextbooks.org/introduction-to-the-modeling-and-analysis-of-complex-systems/

他にも様々な分野の本がありますので気に入った本をダウンロードして読んでみてください。

量子力学の圏論(カテゴリー論）による図式表示Quantum in Picturesの日本語参考サイト

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前に紹介したBob Coeckeさんの「量子力学を数式ではなく絵で利用する」、という話の参考になりそうなサイトの紹介です。Coeckeさん自身によるQuantum in Picturesの解説や教科書、解説動画、量子コンピュータへの応用については前の紹介記事をご覧ください。

量子コンピュータについての市民講演会動画と、Quantum in Picturesの解説講義シリーズの紹介です。

今回は日本語で読めるカテゴリー論によるString図というものの解説サイトや本があったので紹介します。
まずこちらにCoeckeさんの本に関連した解説があります。

String Diagram を学ぶ — カテゴリー論入門 (1)
https://www.marulabo.net/docs/category01/

また中平健治先生の新刊『ストリング図で学ぶ圏論の基礎』もストリング図をあつかっていて参考になりそうです。
サポートページもものすごく充実しています。https://sites.google.com/view/nakahira/%E5%9C%8F%E8%AB%96

Mathematicaの本格的な使い方の実例が満載の動画が公開されました！Mathematicaの代替品を目指すソフトウエアがあることを初めて知りました。

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数式処理ができる数学ソフトウエアであるMathematicaについての動画がアップロードされていました。Stanford大学のDavid Stork教授による動画です。
Computational Symbolic Mathematics: A Course Overview
https://youtu.be/cWV5rIOwPHU?

教授はMathematicaを科学研究と学習に役立てる方法を教える次の講義（Stanford大学）をしている方です。画像解析の専門家でもある先生です。
CME294　
Computational Symbolic Mathematics
https://bulletin.stanford.edu/courses/2246981
残念ながらこの講義はオンラインでは見ることができないのですが、どんな講義かをこのYouTube動画でうかがうことができます。
科学では数値計算が大活躍していますが、数値計算でなく数式で表してそれを解くということも必要になります。たとえば手計算で2時間かかる級数の無限和の計算をMathematicaでやると一瞬に終わるということがよくあるわけです。
数値計算の講義と並行して、数式処理システムの講義が必要な理由です。教科書にでている多くの数式はMathematicaを使って解くことができるので、コンピュータによる数式処理システムの知識は学習にも必須の道具となるわけです。
この動画ではMathematicaをどのように使って手の計算では何年もかかるような複雑な問題を解くか、そのテクニックをいろんな例で披露してくれています。アメリカの大学生の数学競技Putnam Competition
https://en.wikipedia.org/wiki/William_Lowell_Putnam_Mathematical_Competition
の問題を解く例も示してくれています。

こうした実例を通じて、さりげない形でMathematicaの使い方のtipsを教えてくれる動画です。
またMathematicaが答えを出せない問題も、ちょっとした数学的センスによる変数変換で解けるようになるなどの実例も教育的です。

動画の中で他の数式処理システムの名前もいくつかでていますが、Mathematicaのオープンソース版を目指す無料で使えるMathics3というのがあるのを初めて知りました。https://mathics.org/
興味のある方はみてみるとよいでしょう。

ChatGPTなどのLLMの仕組みを本格的に解説する一般向け講義と、Yale大学の物理一年生用の入門講義を紹介します。

投稿日: 投稿者: root

こちらのツイートにある動画は、ChatGPTなどLLMの仕組みを詳細に一般向けに解説している本格的動画です。Open AIに所属していた(今はどうなんでしょう？）人による動画で今ものすごく評判になっているものです。まだみていませんが、充実した動画みたいです。ツイートを埋め込んでおきます。

Deep Dive into LLMs like ChatGPT
https://youtu.be/7xTGNNLPyMI?

もう一つ紹介したいのはYale大学の物理学の講義動画です。
Fundamentals of Physics I
https://www.youtube.com/playlist?list=PLFE3074A4CB751B2B
ニュートン力学、相対性理論、波、そして熱力学をあつかっている物理初心者向けの講義です。講義資料もダウンロードできます。演習問題とその解答なども資料に含まれています。https://oyc.yale.edu/physics/phys-200　
この講義のページの資料ダウンロードのリンクは切れているので、Internet archiveのWayback machineにurlをいれて保存されているzipファイルをダウンロードしてください。切れているリンクはこちら。
Course Materials　Download all course pages [zip – 10MB]
http://openmedia.yale.edu/cgi-bin/open_yale/media_downloader.cgi?file=/courses/fall06/phys200/download/phys200.zip
コピーしてhttps://web.archive.org/
にいって検索窓にペーストしてアーカイブされている過去ページからダウンロードします。
この講義をもとにした本も売っています。
https://yalebooks.yale.edu/book/9780300243772/fundamentals-of-physics-i/

続きの講義も動画が公開されています。
Fundamentals of Physics II
https://www.youtube.com/playlist?list=PLD07B2225BB40E582
電磁気学、光学、量子力学
こちらも同様に、コースの資料がダウンロードできます。
https://oyc.yale.edu/physics/phys-201
Course Materialsはやはりリンクがきれているので、同様にInternet archiveのWayback machineにurlをいれてダウンロードしてください。

本も売っていてこちらのリンクから試し読みもできます。
https://yalebooks.yale.edu/book/9780300243789/fundamentals-of-physics-ii/

英語版のGitとGitHubの入門記事が公開されました！

投稿日: 投稿者: root

Beej’s Guidesというサイトがあります。
https://beej.us/guide/
ネットワークやネットワークプログラミング（これは本として出版もされています）、C言語やPythonその他いろんな入門記事があつまっています。このサイトにGitの入門記事が今日公開されました。Git, GitHubをまったく知らない人向けの記事で、GitとGitHubの基本的な理念から理解して使いこなせるようになるのを目指す記事のようです。評判になっているのでリンクを紹介しておきます。

Beej’s Guide to Git
https://beej.us/guide/bggit/
わかりやすい解説だと思います。是非読んでみてください。