タグ: ソフト

RDKit入門の記事があります。

化合物情報をコンピュータで扱うケモインフォマティクスの分野でよく用いられるライブラリにRDKitというのがあります。このRDKitはPythonで使うライブラリで、その導入方法、使い方についてのよい記事があったので紹介し…

投稿日: 2024年9月21日投稿者: root

Pythonで量子化学の計算をする方法を紹介しているサイトがあります。ラボコードというサイト（LabCode) にある記事です。【PySCF】Pythonで始める量子化学計算【一点計算】 https://labo-co…

投稿日: 2024年9月19日投稿者: root

Interpretable Machine Learning A Guide for Making Black Box Models Explainable という機械学習を使うときに知っていた方がよい大事な注意点に焦点…

昨日紹介したAlphaFold DatabaseでのFoldseekの使い方をスクショを交えて説明してみます。こちらをクリックしてみてください。https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P06…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月13日投稿者: root

Open AIのChatGPT有料版で使える新しいモデルOpenAI o1とOpenAI o1-miniが発表されました。o1のほうは京大や東大の入試問題の数学を合格レベルの正答率で解くことができるようになっているそうで…

投稿日: 2024年9月11日投稿者: root

YouTubeのおすすめに以下の動画がでてきました。TogoTVの最新の動画です。『Metascapeを使って遺伝子リストの生物学的解釈をする』 https://youtu.be/WqkIM_i55CM?si=iByX…

投稿日: 2024年9月5日投稿者: root

今日は立教大学の川畑泰子先生のホームページを紹介します。 https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/kawahatab24/introduction この先生のサイトには様々な社会物理学…

投稿日: 2024年9月4日投稿者: root

楽しみにしていた『計算物理　春の学校2024』の動画が公開され始めました。 YouTubeのチャンネルから視聴できます。https://www.youtube.com/@comp_phys_spring_school20…

投稿日: 2024年8月30日投稿者: root

台風は福岡からどんどん離れていっています。衛星ひまわりの画像では台風の雲がはっきりみえなくなって、台風が消滅したのにまだ気象庁が台風があるといいはっているなどというSNSの意見もあったようです。先日紹介したhttps:/…