The Nomura Institute of Glycosciece Blog

今朝はひさしぶりに　ほんげんぎょう　を見にでかけました。朝6時半点火が二か所、午前8時点火と午前9時点火の合計４カ所での実施です。私達は６時半点火と８時点火を見に行きました。夜半には激しい雨が降ったので心配していましたが、点火時刻前には止んで、濡れることもなく現地に到着しました。火を扱う行事なので消防団の消防車もやってきて近くで皆さんそばで、待機してくださっていました。しだいに夜があけてきて、左の写真のころには、空にまんまるの月がかかっているのが、雲の間から見えていました。火の粉をあびるとよいことがあるそうです。

今日のリンクは面白いSFの読めるサイトの紹介です。
「毎月27日は仏壇の日！　八島游舷の創元SF短編賞受賞作「天駆せよ法勝寺」を期間限定無料公開」と題された、Web東京創元社マガジンのサイトです。サイトから「てんくせよ　ほっしょうじ」という短編SFがいまのところ無料でよめます。いつまで限定公開しているのかはわかりませんのでお早めにお読みください。

http://www.webmysteries.jp/archives/30623071.html

佛理学という言葉をはじめて知りました。お寺が宇宙船になって宇宙を飛ぶというお話で、面白いですよ。著者の八島游舷さんのサイト
https://yashimayugen.com/
にはこの作品で使われている用語を開設した用語集
https://yashimayugen.com/works/related-info/hosshoji-glossary/
やIME用の変換辞書
https://yashimayugen.com/wor/related-info/buddhic-terms-dictionary/
なども用意されていて　のりのりのサイトです。
「応信せよ尊勝寺」https://www.amazon.co.jp/dp/B0BFQ6NRL7/というこの短編の前日譚も刊行されており、長編版も執筆中とのことで楽しみです。

東京大学の 次世代知能科学研究センター（UT AICenter）主催の 第11回連続シンポジウム「共進化する物理学と人工知能の現在」 の動画
https://youtu.be/Zikx09oV9Pw
が公開されています。
これは物理学に人工知能を応用するという新分野のよい紹介になっています。

YouTubeのUT AICenterのチャンネル
https://www.youtube.com/@utaicenter1332
には他にもシンポジュウムの動画がありますのでご覧ください。

上の動画のYouTubeのページによると、以下のような内容でシンポジュウムが進行しています。

00:00 ご挨拶・趣旨説明
02:25 樺島祥介（東京大学大学院理学系研究科）「物理とAI〜これまでとこれから〜」
15:42 大槻東巳（上智大学理工学部機能創造理工学科）「深層学習による波動関数の解析と生成」
38:05 小林研介（東京大学大学院理学系研究科​​）「量子テクノロジーと機械学習」
1:01:32 村尾美緒（東京大学大学院理学系研究科）「量子系をプログラミングする」
1:21:00 橋本幸士（京都大学大学院理学研究科）「深層学習と重力時空」
1:40:50 パネルディスカッション「共進化する物理学と人工知能の現在」

最後のパネルディスカッションには脳，カオス，複雑系、ゲノムなどに関連した数理的基礎問題を研究されている東大の合原一幸先生も参加されていて面白かったです。最初の趣旨説明の部分でAIの定義やそれがどう物理学に関わるかを、プランクの量子の発見やティコブラーエのデータからのケプラーの法則、ニュートン力学の形成などを例にとってわかりやすく解説してくださっています。その後の各講演の内容は専門的で、細部の理解はとうてい無理ですが、AIが物理学に応用されている現場の様子を垣間見ることができると思います。興味のある方は是非ご覧ください。
ただ一つお願いは、動画のバックに音楽を流すのは止めてほしいです。

中澤港先生のtwitterで科学史研究という雑誌に、九州大学の
横山尊先生による論文「科学史入門　日本の優生学史研究のこれからを考えるために : 相模原事件と優生保護法報道への所見」（『科学史研究』2020 年 60 巻 297 号）が掲載されており、J-Stageで読めるようになっていることを知りました。
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jhsj/60/297/60_66/_article/-char/ja/
生命科学を学ぶものにとって、考えるべき、大変重い問題ですので是非読んでみられることをおすすめします。「科学史研究」には他にも、小特集 「進化論誤用・悪用・濫用」問題
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jhsj/60/299/60_245/_article/-char/ja
など面白い記事があります。ご覧になると面白いと思います。

皆さんお正月はいかがお過ごしですか。福岡では大晦日から本当によい天気が続いていて、これほど天気がつづく暖かいお正月は珍しいです。私達は今朝は宇美八幡宮に参拝にでかけました。10時過ぎに到着したのですがものすごい人出でした。鳥居の外から長い列ができていて、本殿での参拝はあきらめて神功皇后を単独で祭っている聖母宮（しょうもぐう）と応神天皇の産湯につかったという産湯の水を参拝しました。名物のおいしい子安餅も長蛇の列でこれも買うのをあきらめました。

twitterはこのごろイーロンマスクさんのおかげで、従来のうっとおしい嫌がらせ風の仕様がなくなり、アプリを使わず登録せずに普通のブラウザで快適にみることができます。逆に以前紹介したnitterのいろんなinstancesでは、ちゃんとみられないことが多いですね。ということで、今日、　Firefoxでtwitterをみていてhttps://twitter.com/jujulife7/status/1609803658392408067　本当にやさしい高校数学の基礎についての無料pdfファイルがあることを教えてもらいました。文字式と方程式からはじまって、場合の数、確率と期待値、統計的な分析、関数や三角比、、証明の仕方や微分、積分、ベクトルなどがとてもわかりやすく解説されています。
「150分で学ぶ高校数学の基礎」というスライドのpdfです。
https://speakerdeck.com/e869120/150-fen-dexue-bugao-xiao-shu-xue-noji-chu
スライドは右下のダウロードボタンを押すとダウンロードできます。
著者の米田優峻さんは東京大学二年生だそうで、国際情報オリンピック ’18, ’19, ’20 の金メダリスト、『「アルゴリズム×数学」が基礎からしっかり身につく本』や『競技プログラミングの鉄則』という本も書いておられます。https://speakerdeck.com/e869120

やさしい数学の入門書を探しておられる方におすすめします。巻末にはもっと深く学ぶための教科書やサイトも紹介されています。

自然科学研究機構 生命創成探究センター/分子科学研究所/計算科学研究センターの奥村久士先生の分子動力学シミュレーション講義が公開されています。先生はタンパク質の分子動力学研究を精力的に進められている方で、生命科学に興味を持つものが分子動力学を学ぶには最適の先生だと思います。講義のテキストも先生のホームページhttp://okweb.ims.ac.jp/からダウンロードできますのでテキストを見ながら講義を聞くことができます。pdfファイルのパスワードは動画で紹介されています。

講義動画はこちらです。分子動力学シミュレーション講義動画　第一章　解析力学
https://youtu.be/6B3BE7-iIPk

第二章　統計力学
https://youtu.be/LYS52olpGGw

第三章　分子動力学シミュレーションの基礎
https://youtu.be/tnKWqTZQS9c

テキストは12章までありますのでそのうちの3章分の講義が5日前に公開されています。是非ご覧ください。

新年あけましておめでとうございます。本年も皆様にとってよいお年でありますように、お祈り申し上げます。また本年も当ブログをどうぞよろしくお願いいたします。

今日の元旦は、世界遺産の「神宿る島」宗像・沖ノ島と関連遺産群
https://www.okinoshima-heritage.jp/を構成している古墳群新原・奴山古墳群を見学に出かけました。
https://www.okinoshima-heritage.jp/know/shimbaru.html
快晴で暖かく、古墳訪問日和です。広い駐車場にはうちの車だけでした。案内所は無人でしたがパンフレットはもらえました。他に人がいなかったので、ゆっくり思う存分きれいな空気をすいながら古墳群を散策できました。この古墳群は、本当に古墳が群れをなして築造されています。

宗像氏の古墳で、円墳と前方後円墳が40以上群れをなして築造されているのをはじめてみました。壮観でした。写真は案内所のモニュメントと、古墳群を駐車場からみた様子です。沢山の円墳がならんでいて奥のほうに前方後円墳がありました。下には一番近くにあった前方後円墳(30号墳）の写真も載せておきます。本当にゆっくり散策できて心洗われる経験ができました。四季折々におとずれてみたい場所です。是非皆様も機会をみつけて訪れてみてください。

予習用にみていた動画もはりつけておきます。https://youtu.be/wl2xjoVzijw

今日は大晦日で家族で光正寺古墳にでかけました。しかしなんと年末で駐車場が閉まっていて、やむなくもう一つの目的地　宇美八幡宮を参拝しました。4時まえに駐車場について車からでると、神主さんが沢山ならんで列をつくり、巫女さんも一緒に宇美神宮からでてこられるのに出会いました。宇美神宮の拝殿の入り口の門にも神主さんが立っておられて、みていると先ほどの一行は、いったん外に出た後ぐるっと回って、正面の大鳥居から入ってきてこちらに向かってこられるのでした。なんと今日は宇美八幡宮の大祓式（たぶん　おおはらえ式と読むのだと思います）の日だったのです。ラッキーでした。夏の大祓式では茅の輪（ちのわ）くぐりという神事もがあるのですが、大晦日の大祓式ではそれはなくて、終了後はただちに除夜祭にうつるのだそうです。境内には沢山お店もでていて、今夜はにぎわっていることと思います。写真は今日撮影した宇美八幡宮の天然記念物のクスノキと、境内にでていたお店です。

本年もこのサイトをみていただいてありがとうございました。来年も皆様にとってよいお年でありますように。

今年もあと一日ちょっとですね。今日は今年の日本分子生物学会で開催されたフォーラムの動画を紹介します。
第45回日本分子生物学会年会　フォーラム「生命科学のデータベース活用法」というタイトルのもので、こちらのリンクに開催趣旨、発表資料、動画へのリンクなどがのっています。https://biosciencedbc.jp/event/exhibition/mbsj45.html

九州大学で沖先生（今は京都大学に移られました）が開発されたデータベースChIP-Atlasの最新情報が聴ける講演
「統合的な転写制御データ基盤の構築 ～ChIP-Atlas update: Bisulfite-seq と ATAC-seq データを統合しエピゲノム制御の全貌に迫る～ 」
https://youtu.be/iOrOJF9_LzU

や
糖鎖科学の最新のポータルサイト「糖鎖科学ポータルGlyCosmos」など、どれも面白い講演ばかりですので是非ご覧ください。
https://youtu.be/SiBCDWmcyI8

最近は学会の動画が、参加しなかったものにも部分的に公開されることが多いのでありがたいですね。知識の共有の時代を活用しましょう！