The Nomura Institute of Glycosciece Blog

野村一也　「科学を学ぶ人のために」　九大野村研ホームページの拡張版です

東京大学の動画： 医学英語論文執筆セミナー2024の動画や高校生のための冬休み講座の動画が公開されました！

投稿日: 投稿者: root

高校生のための冬休み講座2024　「幾何学における非存在性」今野北斗准教授
https://youtu.be/j1utzNuXb1g?si=QgjANFQQZ0mdCu8G

これは2024年１２月に開催された高校生むけの冬休み講座の数学の動画です。私はライブで見逃したのですが、これから物理学、生物学など全部の講演動画が公開されると思います。この数学についての講演では、n次元多様体とか斜影空間とか、耳慣れない言葉の意味が解説されています。現代数学の入門になる動画ではないでしょうか。。

こちらは、東大で開催されていた医学英語論文執筆セミナーを公開して下さっている動画です。最近は有料で英語論文執筆についての講演などがよく開催されていますが、無料でこのレベルの動画が視聴できるのですからこれを見ない手はありません。

【必ずacceptされる医学英語論文執筆のコツ　基礎コース「初心者も安心、論文執筆の心構えと準備」】_康永秀生　2024医学英語論文執筆セミナー
https://youtu.be/RfZw5PyOHx0?si=BxY68tTs7i7_F8av

このところAIが普及して研究者が英語論文を執筆する際の校閲などは手軽にできるようになりました。しかし一度も英語論文を書いたことのない人の場合は、ChatGPTなどに書いてもらってもなかなか思ったようには書けないものです。この動画を見ることで、医学英語論文に限らず、生命科学系の論文の執筆法の基礎が学べます。おすすめの動画です。発展コースの動画も公開されています。
【必ずacceptされる医学英語論文執筆のコツ　発展コース「なぜあなたの論文はacceptされない？」】_康永秀生　2024医学英語論文執筆セミナー
https://youtu.be/x-yVmtacDOA?si=PyjYWCWEJjGLdxJ5

是非、基礎と発展両コースを見ることをお薦めします。講師の先生は医学英語論文執筆法についての本を多数書かれていて、大変勉強になります。

日本語で学べる物理の講義動画シリーズを紹介します。

投稿日: 投稿者: root

物理の講義シリーズの紹介です。

高校レベルからの物理の講義は、東北大学の大関真之先生の動画が一押しです。
再生リストはこちら：
『みんなと物理　大学受験対策も学び直しもここからできるよ！』
https://youtube.com/playlist?list=PLsBJ3psEqyr9lVENrOBwVaqw1xrmM0DpP&si=-cXqJFw0775Noooi
力学から電磁気学、熱力学までの講義があります。最新の動画はこちらです。
【受験生必見！みんなと物理】第11回: 熱サイクルで熱力学マスター！【Education Open Style】
https://www.youtube.com/live/__iT5Wyd5sg?si=8wBpi145mFFtwjNv

大学レベルでも大関先生の応用数学AとB,量子力学Bを学べば物理の理解が格段に深まるだろうと思います。リンクは大関先生のYouTubeチャンネルやこのブログの過去記事をご覧ください。量子コンピュータや機械学習の講義もあります！
https://www.youtube.com/@mohzeki22/playlists

物理の詳しい講義としては以前紹介したこちらの動画もおすすめします。
『理論物理への歩み』というチャンネルです。市井の理論物理屋を増やしたい！という願いをこめて公開されている動画シリーズです。
https://www.youtube.com/@%E7%90%86%E8%AB%96%E7%89%A9%E7%90%86%E3%81%B8%E3%81%AE%E6%AD%A9%E3%81%BF/playlists
高校生レベルの初歩の物理学からはじまって物理学専攻の学部レベルの講義が学べます。波動や電磁気学の基礎、理論物理学の数学、さらに理論物理学入門と題して、古典力学、統計力学、量子力学、相対性理論などの日本語での講義が学べます。物理学を本格的に学びたい人には得難い講義シリーズです。こつこつと更新がつづいており今現在295本の動画があります。大学にいかなくても物理が本格的に学べます。最初の動画を埋め込んでおきます。
『物理の第一歩　Ⅰ.基礎の力学-1』
https://youtu.be/BTLOkUQsL-0?si=bxmTH6FAnWg0Qwql

DeepSeekの新しいAIが話題沸騰しています。

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世の中すすんでいきますね。OpenAIのChatGPTに勝るとも劣らないLLMが中国のDeepSeekという企業 からMITライセンスで公開されたそうです。オープンソースで透明性があるAIで、なんと家庭用で使えるモデルまで公開されたそうです。一家に一台　LLMの時代がきたんですね！

量子コンピュータについての市民講演会動画と、Quantum in Picturesの解説講義シリーズの紹介です。

投稿日: 投稿者: root

YouTubeのおすすめ動画でこんなのがあるのを知りました。
「量子コンピュータとは何か？―情報学と最先端の物理学理論が融合した先を見据える」添田 彬仁 – 国立情報学研究所 2024年度 市民講座 第2回
https://youtu.be/crEXqvuOay4?si=Y-jIzx7m_vkFeUcS

つい最近（先月の18日=2024年12月18日）開催された一般市民向けの講演会の動画です。
量子コンピュータについて知るにはよい動画のようです。見てみようと思います。スライドもダウンロードできるリンクがYouTubeのページにのっているのでダウンロードしてみて、面白そうだったら見るのもよいと思います。

量子コンピュータといえば、先日紹介したBob Coecke (Quantinuumという量子コンピュータの会社とUniversity of Oxfordの教授)の動画があります。彼は圏論をもとに量子計算を図で行うという手法を開発した研究者です。記事へのリンクを張っておきます。

英国ケンブリッジにあるNewton Instituteで開催された量子コンピュータについての講演会動画が公開されています。

その前の記事ではThe Royal Institutionでの彼の講演を紹介しました。

図式による量子論―圏論をもとにした量子力学の定式化についてのわかりやすい講演が公開されています。

この講演では彼の量子力学の計算を図で実行するという手法が解説されていましたが、その手法のもっと詳しい解説動画があるので、是非そちらの動画も見てください。ガーナにある大学向けの連続講義動画Quantum in Picturesです。再生リストはこちらです。一時間程度の解説が9回まとまっています。
Quantum in Pictures: A New Way to Understand the Quantum Worldという本の内容を詳しく解説しているので必見です。
https://youtube.com/playlist?list=PLrf_yCwRA6PUCSMHPXUTeZFQk4yXjw_6b&si=Y3rKmNvpPh53Iufo
第一回の動画を埋め込んでおきます。
https://youtu.be/IBciXyV04jw?si=miaswxZWmFfFSBMI

この動画があるチャンネルMathematical and Computational Physics – KNUST　には他に多数の動画があるのでそちらも面白そうです。
https://www.youtube.com/@MCP-KNUST

Pythonパッケージ管理ツール”uv”を使ってみましょう！

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LinuxでPythonをインストールする時pipとかcondaを使っていますが、最近pythonのパッケージ管理ツールとしてuvというのがあるのを次の記事で知りました。

『Rust製のPythonパッケージ管理ツール「uv」を使ってみよう』　門脇諭（かどわきさとる）
https://gihyo.jp/article/2024/03/monthly-python-2403

興味をもったのですが、使い方はまだわかりませんでした。その使い方を解説している動画がToｇoTVにアップロードされたので見てみようと思います。TogoTVの動画の紹介欄を引用します。

『uvは、2024年の2月中旬に発表された新しいPythonのパッケージ管理ツールです。uvは高速な動作、クロスプラットフォーム対応のロックファイル、ツール管理の専用インターフェースを提供することで、快適な開発環境を実現しています。uvを用いることで、依存関係の管理やPythonのバージョン管理が容易になります。プロジェクト全体の管理のみならず、仮想環境やpipの代替としてや、インラインスクリプトの実行やPythonバージョン管理だけを行いたい場合にも有用なツールとなっています。今回はWSL2を用いたLinux環境でuvの説明を行います。なお、WSL2の導入方法については「WSL2(Windows Subsystem for Linux 2) を導入してWindows10(11) にLinux環境を構築する」をご覧ください。 』

動画のYouTube版を埋め込んでおきます。
https://youtu.be/vFd0gUcPOW8?si=e6YRCqkSYf01PI_C

糖鎖生物学のものすごく有用なサイトの紹介です―その1

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私の専門の糖鎖生物学ですが、さまざまな有用なサイトがネットにあふれています。これから時々、そうしたサイトを紹介していこうと思います。今日は第一回目です。

今日は、ノーベル化学賞受賞者のCarolyn Bertozzi さんが創設メンバーの一人になっている製薬会社Palleon Pharmaceuticalsの糖鎖生物学のサイトを紹介します。
https://palleonpharma.com/glycobiology-education-hub/

糖鎖と免疫生物学の動画などがあって大変勉強になるサイトです。たとえばこんな動画があります。
https://www.sitcancer.org/viewdocument/2024-glyco-immunology-webinar-serie

また、糖鎖生物学についての情報源もいろいろ掲載されているので是非訪れてみてください。糖鎖生物学の有名な教科書Essentials of Glycobiology 4th editionのNIHのページへのリンクも載っています。（本を一冊まるごとダウンロードできるリンクはのっていません。私のこちらの記事にダウンロードリンクがあります。）

さらにありがたいのは、ツイッターで糖鎖生物学関係の情報を発信しているアカウントのリストもあることです。
https://x.com/i/lists/1689730584749166775
このリストにアクセスするとPalleonがリストしている糖鎖生物学関係のアカウントの最新のツイートが読めます。どんなアカウントがあるかは、Membersというタブをクリックするとみることができます。皆さんもこの中からよさそうなアカウントを見つけるとよいでしょう。

私はXのアカウントをもっていないので、もっぱらnitterのインスタンスでツイートを見ています。https://xcancel.com/i/lists/1689730584749166775でみることができるのでXにアカウントがない人はこちらのリンクをためしてみてください。Membersというタブを押すと、リストをみることができます。

今井むつみ先生の講義動画と、Blueskyでみつけた英語論文の書き方についてのツイートを紹介します。

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今井むつみ先生の本は、岩波新書の「英語独習法」を紹介したことがあります。大変わかりやすく、英語の勉強の参考になる本でした。
最近書かれた中公新書の「言語の本質ことばはどう生まれ、進化したか」今井むつみ／秋田喜美 著　は、読み始めたもののオノマトペとかいう概念に強烈な違和感をもってしまって挫折しました。この本は多くの賞をとっているのできっと良い本なのでしょうが、私には読み進めない本でした。
https://www.chuko.co.jp/shinsho/2023/05/102756.html
そんな今井むつみ先生の講義動画が公開されています。これを見たあとなら中公新書もわかるかもしれないと思いました。動画はまだみていませんが、今井先生の考えておられる基本的な概念を解説しておられるので、ひまができたら一度見てみたいと思います。

講義「言語習得を可能にするのは何か―記号接地、アブダクション、ブートストラッピング」（今井むつみ）／総研大日本語言語科学特別講義・第145回NINJALコロキウム
https://youtu.be/2AoSAazI43o?si=zQf6YKj9KE7fx0Gx

話は変わりますが、英語の論文の書き方について参考になるツイートを埋め込んでおきます。こちらの記事で紹介したBlueskyのScience Newsのツイートです。

High-quality manuscripts complement scientific value and readability

“Views and suggestions for young scientists and early-career researchers on how to prepare a high-quality manuscript.”

PDF:
www.cell.com/action/showP…

[image or embed]

— Science News (@scinews.bsky.social) 2025年1月15日 23:34

Ten simple rules for structuring papers

PDF:
journals.plos.org/ploscompbiol…

[image or embed]

— Science News (@scinews.bsky.social) 2025年1月15日 22:41


このツイートの右下にあるRead 1 reply on Blueskyをクリックすると関連ツイートが二つほど読めるようになります。どれも論文の構成を考える上で大変役立つアドバイスになっています。是非ご覧ください。

Deep Learning for Molecules & Materialsという本が公開されています。

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自然科学系の人に役立ちそうな深層学習の本があります。Deep learning for molecules & materialsというタイトルの本でこちらのurlから読むことができます。https://dmol.pub/
Pythonを使って学ぶ深層学習の本で、化学や材料科学を学ぶ人向きの教科書です。
ローカルで読みたい人はこちらにやり方が書いてあるので見てください。
https://github.com/whitead/dmol-book
この本は、Pythonを知っていることを前提としています。Pythonを知らない人は、まずこちらの資料などで学ぶとよいと本の最初の方に書いてありました。
http://education.molssi.org/resources.html#programming
この資料のおいてあるサイトは量子化学、分子動力学などの入門資料もあって、とても役立ちそうです。併せてご覧になるとよいと思います。

著者のWhite先生（ロチェスター大学）のプレプリントなどはこちらから読めます。
https://arxiv.org/search/cs?searchtype=author&query=White,+A+D
最近はやりのLLMの科学への応用についてのプレプリントが多いですね。

第二次世界大戦のさなかで忘れ去られてしまった科学者たちについての動画がでました。

投稿日: 投稿者: root

昨日に続いてThe Royal Institutionからの講演動画を紹介します。

The forgotten scientists of WWII – with David Clary
https://youtu.be/cJM26a_d_PQ?si=Ls0G87YC-DjsPMiG

この動画では、量子化学の化学反応論（衝突理論）の研究で著名なSir David Clary FRS（Fellow of the Royal Society）が第二次世界大戦のために世間から忘れ去られてしまった悲劇の科学者（ドイツやヨーロッパからの英国への難民希望が拒否された人々など）について語っています。彼の新著　Lost Scientists Of World War II　（https://geni.us/x8hae）についての動画です。面白そうですね。オッペンハイマーのように難民となっても働き場所を見出して大活躍した科学者ではない悲劇の科学者ということで、The Lost Oppenheimersという副題がついている動画です。教授は、波動力学のシュレーディンガーが属していた英国Oxford大学のMagdalen Collegeの学長を2005から 2020まで務めていた方です。量子化学の専門家ですので、Oxford時代のシュレーディンガーについての有名な本Schrodinger In Oxfordも書いておられます。シュレーディンガーはThe Royal Institutionのこの講堂で1928年に波動力学についての講演（Four Lectures on Wave Mechanicsという本になっています）をしたのだそうです。この本はこちらからダウンロード可能です。https://archive.org/details/fourlecturesonwa00schr/page/n5/mode/2up
Faradayをはじめ綺羅星のごとく輝く研究者がここで講演しているんですね！

英国ケンブリッジにあるNewton Instituteで開催された量子コンピュータについての講演会動画が公開されています。

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このブログで以前とりあげた（末尾のリンクを参照）英国CambridgeにあるNewton Instituteで次の講演会が開催されました。

Quantum Computing: Applications and Challenges　2024年11月12日
プログラムはこちらです。
https://gateway.newton.ac.uk/event/ofbw71/programme

残念ながらパンゲノムについての講演動画は公開されていないのですが、1月8日の記事で紹介したBob Coecke (Quantinuum), (University of Oxfordの教授)の講演や量子暗号についての講演などは見ることができます。Coecke教授の講演ではChatGPTなど現在のLLMではどうして結果がでるのかのメカニズムがあきらかになっていないこと、これに対して現在開発中の量子AIではその動作メカニズムを見て理解できることが強調されています。教授はChatGPTの登場以前から言語モデルの量子コンピュータでの重要性を提唱していた先見の明がある研究者ですので、見る価値がある動画だと思います。
Title: Interpretable Quantum AI, Efficient, and Scalable
Speaker: Professor Bob Coecke (Quantinuum)
https://youtu.be/pEh1Z3zorZo?si=PtnDArG6wU-K5W-w

次のリンクはこのブログの過去記事です。Penroseの講演動画とNewton Instituteについて紹介しています。

アイザック・ニュートン研究所の動画がYouTubeで公開されています。