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似た立体構造のタンパク質をFoldseekで探してみよう！

昨日紹介したAlphaFold DatabaseでのFoldseekの使い方をスクショを交えて説明してみます。こちらをクリックしてみてください。https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P06…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月13日投稿者: root

Open AIのChatGPT有料版で使える新しいモデルOpenAI o1とOpenAI o1-miniが発表されました。o1のほうは京大や東大の入試問題の数学を合格レベルの正答率で解くことができるようになっているそうで…

投稿日: 2024年9月11日投稿者: root

YouTubeのおすすめに以下の動画がでてきました。TogoTVの最新の動画です。『Metascapeを使って遺伝子リストの生物学的解釈をする』 https://youtu.be/WqkIM_i55CM?si=iByX…

投稿日: 2024年9月4日投稿者: root

楽しみにしていた『計算物理　春の学校2024』の動画が公開され始めました。 YouTubeのチャンネルから視聴できます。https://www.youtube.com/@comp_phys_spring_school20…

投稿日: 2024年8月25日投稿者: root

いつも国立国会図書館のデジタルライブラリにはお世話になっています。利用登録をすませた方向けに簡単に詳細検索の例をお見せしたいと思います。まず次の写真にある、トップページhttps://dl.ndl.go.jp/から詳細…

投稿日: 2024年8月20日投稿者: root

創薬のための機械学習入門創薬に機械学習が活用されています。日本語でのよい入門講義としては、京都大学大学院医学研究科　鎌田真由美准教授による次の講義の動画がおすすめです。計算生命科学の基礎10 ｜創薬のための機…

投稿日: 2024年8月20日投稿者: root

今日は一日ChatGPTにExcelデータファイルの整形をやってもらう作業をしていました。日本語でプロンプトを書いていたのですが、できたファイルをダウンロードしてみるとうまくできていない→ここがまちがっているからやりなお…

先日、第68回物性若手夏の学校のテキストが公開されのを紹介しました。私のおすすめの記事の一つが次の記事です。 2次元と3次元をつなぐ計算物質科学入門小野頌太 p. 1-24 発行日: 2024年公開日: 2024…

投稿日: 2024年8月14日投稿者: root

こちらのツイートで、Transformerの基本論文の日本語詳細解説のページを教えてもらいました。 Transformerを提案した「Attention Is All You Need」の日本語解説記事で、一番詳しそうな…