カテゴリー: Tips

RDKit入門の記事があります。

化合物情報をコンピュータで扱うケモインフォマティクスの分野でよく用いられるライブラリにRDKitというのがあります。このRDKitはPythonで使うライブラリで、その導入方法、使い方についてのよい記事があったので紹介し…

投稿日: 2024年9月29日投稿者: root

昔よく手に取っていた「これから出る本」(日本書籍出版協会）という書籍の近刊案内がありました。去年12月で休刊になってしまい、よくみていたのに残念と思っていました。しかし日本書籍出版協会その他の団体が共同で設立した一般社団…

先日は「イシューからはじめよ」という本が、研究を進めるのに役立つという話をしました。今日は研究の進め方について、国立情報学研究所の佐藤竜馬先生が機械学習若手の会2024で招待講演をされた時のスライドを公開しておられますの…

投稿日: 2024年9月24日投稿者: root

全5巻からなる日本料理の全貌を記した教科書『日本料理大全』が京都府立大学、日本料理アカデミーの共同事業として日本語版、英語版の両方とも無料公開されました。京都府立大学のホームページによりますと、『京都府立大学では、本学包…

投稿日: 2024年9月21日投稿者: root

Pythonで量子化学の計算をする方法を紹介しているサイトがあります。ラボコードというサイト（LabCode) にある記事です。【PySCF】Pythonで始める量子化学計算【一点計算】 https://labo-co…

投稿日: 2024年9月19日投稿者: root

Interpretable Machine Learning A Guide for Making Black Box Models Explainable という機械学習を使うときに知っていた方がよい大事な注意点に焦点…

今日は旧暦の8月15日、中秋の名月の日だそうです。福岡でも秋の空が澄みわたり、きれいな月がかかっています。月のすぐそばには土星が光っています。さて今日の記事です。このブログでは国立国会図書館デジタルコレクションの個人…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月13日投稿者: root

Open AIのChatGPT有料版で使える新しいモデルOpenAI o1とOpenAI o1-miniが発表されました。o1のほうは京大や東大の入試問題の数学を合格レベルの正答率で解くことができるようになっているそうで…

投稿日: 2024年9月11日投稿者: root

YouTubeのおすすめに以下の動画がでてきました。TogoTVの最新の動画です。『Metascapeを使って遺伝子リストの生物学的解釈をする』 https://youtu.be/WqkIM_i55CM?si=iByX…