カテゴリー: linux

Pythonパッケージ管理ツール”uv”を使ってみましょう！

投稿日: 2025年1月19日投稿者: root

LinuxでPythonをインストールする時pipとかcondaを使っていますが、最近pythonのパッケージ管理ツールとしてuvというのがあるのを次の記事で知りました。『Rust製のPythonパッケージ管理ツール「…

投稿日: 2025年1月16日投稿者: root

自然科学系の人に役立ちそうな深層学習の本があります。Deep learning for molecules & materialsというタイトルの本でこちらのurlから読むことができます。https://dmol…

投稿日: 2025年1月11日投稿者: root

コンピュータサイエンスを学ぶときに必須ですが、あまり講義ではとりあげられないLinuxのシェルの知識、コマンドラインの使い方とか、エディタの使い方、Gitによるバージョン管理などについての講義が MIT(マサチューセッツ…

今ではショウジョウバエのコネクトームも解明されましたが、線虫C. elegansはそのすべての神経細胞の神経回路の接続（コネクトーム）が解明された最初の多細胞生物です。コネクトームという単語に含まれているオームというのは…

投稿日: 2024年11月27日投稿者: root

今日は日本語のOCRソフトを二つ紹介します。一つ目は、日本の古文書（江戸期以前や）をOCRするソフトウエア『NDL古典籍OCR-Lite』です。国立国会図書館がCC BY 4.0ライセンスで公開するソフトウエアです。 …

投稿日: 2024年8月20日投稿者: root

創薬のための機械学習入門創薬に機械学習が活用されています。日本語でのよい入門講義としては、京都大学大学院医学研究科　鎌田真由美准教授による次の講義の動画がおすすめです。計算生命科学の基礎10 ｜創薬のための機…

先日、第68回物性若手夏の学校のテキストが公開されのを紹介しました。私のおすすめの記事の一つが次の記事です。 2次元と3次元をつなぐ計算物質科学入門小野頌太 p. 1-24 発行日: 2024年公開日: 2024…

投稿日: 2024年5月26日投稿者: root

Pythonの環境構築法(インストール法）がまとめてあるサイトなどを紹介します。 Python Japanのサイトがおすすめです。 https://www.python.jp/index.html このサイトには、Pyt…

投稿日: 2024年3月30日投稿者: root

今日はパソコン修理でて時間をとっていたので、簡単な記事です。 AIで画像を生成するやりかたがわかりやすくまとまっている記事をみつけたので紹介しておきます。『AIイラストが理解る！StableDiffusion超入門【2…

タンパク質の立体構造を表示するのにPyMOLをよく使います。PyMOL自体に、表示した画像をエクスポートして保存する機能はあるのですが、論文に使えるような図をつくるのは大変でした。なんとその問題点を解消する新しいPyMO…