カテゴリー: 生命科学

分子動力学MD法の無料教科書が公開されています。

分子動力学はタンパク質などの生体高分子の挙動を計算するのによく用いられる手法です。このブログでも何度か紹介しましたが、今日は分子動力学の無料でよめる教科書が公開されていますので紹介します。こちらからダウンロードできます。…

投稿日: 2023年8月13日投稿者: root

Geoffrey Hintonは深層学習分野の巨人であり、2000年代前半までのニューラルネットワーク研究の停滞期を終わらせ、今日の隆盛の基盤を築いたことで知られています。彼は、彼が開発したディープビリーフネットワークを…

投稿日: 2023年8月9日投稿者: root

医学生物学の創薬のサイトなどをみていると、トランスレーショナルリサーチとか、トランスレーショナルサイエンスなどというカタカナ語が頻出して、なんのことやらよくわからなくなりませんか？あるいは意味不明の英語の略語が頻出してネ…

投稿日: 2023年8月7日投稿者: root

PyMOLでは、PDBのサイトにあるタンパク質なら、登録番号をいれるだけで一発で立体構造を表示できます。しかし、AlphaFold2で予測されたpdbファイルはPDB のサイトにはないので、AlphaFold　Prot…

昨日は人工雪の作成の時に使うバクテリアがもつ、雪の結晶形成促進作用があるタンパク質inaZの立体構造をweb pageに埋め込んでみました。コードを書かかったので、今日はコードと、それをhtmlファイルに書き込んだ後の…

投稿日: 2023年8月4日投稿者: root

私のブログの様なweb pageで、分子の立体構造を表示して、マウスで動かしたりできるようにするにはどうしたらよいでしょうか。昨日紹介した山本典史先生がこちらのページで、そのやり方をわかりやすく書いてくださっています…

投稿日: 2023年8月3日投稿者: root

今日は九州大学化学科卒で、九州大学大学院で修士、博士の学位をとられた、山本典史（Yamamoto, Norifumi）先生のサイトを紹介します。現在、千葉工業大学 / 応用化学科 / [計算化学研究室 https://y…

本日のカレントアウエアネスポータル（国立国会図書館のポータルサイトです https://current.ndl.go.jp/）に「アカデミックライティングにおけるChatGPTの活用法（文献紹介）」という記事がでました…

投稿日: 2023年7月29日投稿者: root

今年2023年はスペースシャトルのコロンビア号の悲惨な空中分解事故から20年目にあたります。20年前の2003年2月１日　コロンビア号はミッションを終えて帰還する際、大気圏突入後　空中分解して搭乗員７名が犠牲になりました…