カテゴリー: 情報検索

似た立体構造のタンパク質をFoldseekで探してみよう！

昨日紹介したAlphaFold DatabaseでのFoldseekの使い方をスクショを交えて説明してみます。こちらをクリックしてみてください。https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P06…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月13日投稿者: root

Open AIのChatGPT有料版で使える新しいモデルOpenAI o1とOpenAI o1-miniが発表されました。o1のほうは京大や東大の入試問題の数学を合格レベルの正答率で解くことができるようになっているそうで…

昔私が英国ケンブリッジのMRC LMBのJohn Whiteラボにいたとき、シドニー・ブレナーさんの講演があるというのでラボの全員がIsaac Newton Institute for Mathematical Scie…

投稿日: 2024年9月11日投稿者: root

YouTubeのおすすめに以下の動画がでてきました。TogoTVの最新の動画です。『Metascapeを使って遺伝子リストの生物学的解釈をする』 https://youtu.be/WqkIM_i55CM?si=iByX…

投稿日: 2024年9月8日投稿者: root

Arxiv.orgはプレプリントサーバーの一つです。このサイトでtextbookと検索窓に入れて探してみると、いろいろ役立ちそうな教科書を見つけることができます。たとえばこんな本がアップロードされています。これはプリン…

投稿日: 2024年9月5日投稿者: root

今日は立教大学の川畑泰子先生のホームページを紹介します。 https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/kawahatab24/introduction この先生のサイトには様々な社会物理学…

投稿日: 2024年9月4日投稿者: root

楽しみにしていた『計算物理　春の学校2024』の動画が公開され始めました。 YouTubeのチャンネルから視聴できます。https://www.youtube.com/@comp_phys_spring_school20…

明治維新の前1863年に、長州藩が密かに英国に留学させた長州ファイブなる5人の長州藩士がいました。長州五傑（ちょうしゅうごけつ）と呼ばれる5名は、井上聞多（馨）、遠藤謹助、山尾庸三、伊藤俊輔（博文）、野村弥吉（井上勝）で…

投稿日: 2024年8月29日投稿者: root

ものすごい台風というふれこみの台風10号、風が午前中から午後4時過ぎまではものすごくて雨がたたきつけるように降っていました。このまま半日も雨が続くと河川があふれるかもと思わせる豪雨で、ちょっと換気のために窓をあけると雨の…