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タンパク質配列解析方法の革命となると思われる新技術がNatureで発表されました！

今までタンパク質のアミノ酸配列を決定する方法としては Edman 分解や質量分析法を使うのが定番でした。DNAの塩基配列の決定法に革命をおこしたナノポアシークエンス法が、ついにタンパク質のアミノ酸配列の決定に実用的に使え…

投稿日: 2024年9月22日投稿者: root

今日9月22日はマイケル・ファラデー（Michael Faraday）の誕生日にあたります（1791年生まれ）。科学版の「今日は何の日」のサイト Today in Science Historyにでているので興味のある…

YouTubeをみていたらロバート・フックのMicrographia　（顕微鏡図譜）についての動画をみつけました。 Hooke’s Micrographia MITx Videos　MITの材料科学のLorn…

投稿日: 2024年9月19日投稿者: root

Interpretable Machine Learning A Guide for Making Black Box Models Explainable という機械学習を使うときに知っていた方がよい大事な注意点に焦点…

昨日紹介したAlphaFold DatabaseでのFoldseekの使い方をスクショを交えて説明してみます。こちらをクリックしてみてください。https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P06…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月14日投稿者: root

今日、発生生物学の教科書の定番　Scott Gilbert他著のDevelopmental Biologyの第13版が去年出版されている知りました。Amazonでみかけたのですが、なんと値段が37449円！　しかし日本の…

投稿日: 2024年9月13日投稿者: root

Open AIのChatGPT有料版で使える新しいモデルOpenAI o1とOpenAI o1-miniが発表されました。o1のほうは京大や東大の入試問題の数学を合格レベルの正答率で解くことができるようになっているそうで…

昔私が英国ケンブリッジのMRC LMBのJohn Whiteラボにいたとき、シドニー・ブレナーさんの講演があるというのでラボの全員がIsaac Newton Institute for Mathematical Scie…

投稿日: 2024年9月11日投稿者: root

YouTubeのおすすめに以下の動画がでてきました。TogoTVの最新の動画です。『Metascapeを使って遺伝子リストの生物学的解釈をする』 https://youtu.be/WqkIM_i55CM?si=iByX…