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タンパク質配列解析方法の革命となると思われる新技術がNatureで発表されました！

今までタンパク質のアミノ酸配列を決定する方法としては Edman 分解や質量分析法を使うのが定番でした。DNAの塩基配列の決定法に革命をおこしたナノポアシークエンス法が、ついにタンパク質のアミノ酸配列の決定に実用的に使え…

投稿日: 2024年9月22日投稿者: root

今日9月22日はマイケル・ファラデー（Michael Faraday）の誕生日にあたります（1791年生まれ）。科学版の「今日は何の日」のサイト Today in Science Historyにでているので興味のある…

投稿日: 2024年9月21日投稿者: root

Pythonで量子化学の計算をする方法を紹介しているサイトがあります。ラボコードというサイト（LabCode) にある記事です。【PySCF】Pythonで始める量子化学計算【一点計算】 https://labo-co…

YouTubeをみていたらロバート・フックのMicrographia　（顕微鏡図譜）についての動画をみつけました。 Hooke’s Micrographia MITx Videos　MITの材料科学のLorn…

投稿日: 2024年9月19日投稿者: root

Interpretable Machine Learning A Guide for Making Black Box Models Explainable という機械学習を使うときに知っていた方がよい大事な注意点に焦点…

投稿日: 2024年9月18日投稿者: root

複雑系の科学で有名なSanta Fe Institute （サンタフェ研究所）の所長David C. Krakauerさんの講演動画がYouTubeで公開されました。彼が書いた本The Complex Worldが9月…

今日は旧暦の8月15日、中秋の名月の日だそうです。福岡でも秋の空が澄みわたり、きれいな月がかかっています。月のすぐそばには土星が光っています。さて今日の記事です。このブログでは国立国会図書館デジタルコレクションの個人…

昨日紹介したAlphaFold DatabaseでのFoldseekの使い方をスクショを交えて説明してみます。こちらをクリックしてみてください。https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P06…

自分が研究しているタンパク質の立体構造をAlphaFoldで推定します。推定結果がでたら次にやってみたいことは、その立体構造と似たタンパク質がないか調べることではないでしょうか。PSI-BLASTなどの相同性検索でアミノ…

投稿日: 2024年9月14日投稿者: root

今日、発生生物学の教科書の定番　Scott Gilbert他著のDevelopmental Biologyの第13版が去年出版されている知りました。Amazonでみかけたのですが、なんと値段が37449円！　しかし日本の…