論文など

 

主な著書
「未来を創るグライコサイエンスー我が国のロードマップー」
このロードマップの英語版がでています。
Glycoscience:Basic Science to Applications 
Insights from the Japan Consortium for Glycobiology and Glycotechnology (JCGG)
です。そのなかの
Technologies to Elucidate Functions of Glycansのセクション4.8に線虫の糖鎖研究への応用についてまとめています。文献が少し変わった程度で内容は上の日本語版と同じです。


「線虫でこそわかる糖鎖の新機能の探究」
野村一也、秋好紗弥香、松田采子、野村和子

糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック~創薬・医療から食品開発まで(NTS、2015)所収

Glycosaminoglycans and Glycosylphosphatidylinositol-Anchor Proteins in Development of Caenorhabditis elegans, Kazuya Nomura, Sayaka Akiyoshi, Ayako Matsuda, Kazuko H. Nomura
In Glycoscience: Biology and Medicine 2014, pp 817-824 (Springer)
Functional glycomics at the level of single cells: Studying roles of sugars in cell division, differentiation and morphogenesis with 4D microscopy, S. Mizuguchi, K. Dejima, K. H. Nomura and K. Nomura, Experimental Glycoscience,
pp 290-294, 2008, Springer
私達の使っていた四次元顕微鏡です。全自動蛍光微分干渉タイムラプス顕微鏡です。 私達のところでは二台稼働していました。微分干渉顕微鏡のステージが自動的に左右、上下に移動しサンプルの三次元的な画像を自動で取得できます。さらにタイムラプスモードにして働かせるので、三次元プラス時間の次元で、合計四次元の情報を自動的に記録できます。さらに通常の透過光による観察と蛍光観察も自動的に出来ます。四次元顕微鏡でとったムービーはトップページにおいてありますのでご参照ください。  線虫を研究するときの具体的な四次元顕微鏡の使い方については英語の本ですが、上記をご覧下さい。
主な論文
Chondroitin proteoglycans are involved in cell division of Caenorhabditis elegans
Souhei Mizuguchi, Toru Uyama, Hiroshi Kitagawa, Kazuko H. Nomura, Katsufumi Dejima, Keiko Gengyo-Ando, Shohei Mitani, Kazuyuki Sugahara & Kazuya Nomura

Nature 423, 443 – 448 (22 May 2003)
糖鎖が初期胚の細胞分裂と関係しているとは世界の誰もが予想していなかったのですが、線虫ではコンドロイチンがないと細胞分裂がうまくいかないということを発見しました。
Involvement of blood-group-B-active trisaccharides in Ca2+-dependent cell-cell adhesion in the Xenopus blastula
Kazuko, H. Nomura, Ryuji Kobayashi, Yoshio Hirabayashi, Megumi Fujisue-Sakai , Souhei Mizuguchi, Kazuya Nomura,
Development Genes and Evolution, 208 (1) 9-18, April 1998
ヒトのABO式の血液型物質は生理的な機能はないと考えられていましたが、発生生物学で良く用いられる材料であるアフリカツメガエルでは初期胚の細胞接着に働いていることがわかりました。これらの発見を元に、細胞の一番外側にある糖鎖を外からいじることで細胞分裂や細胞分化を操ることができる可能性は以下にまとめてみました。
糖鎖を介した細胞分裂・細胞分化制御工学の展開
野村一也、野村和子、水口惣平,
化学工業
、46(10)、46-52, 2003
最近の論文や総説
Regulation of triacylglycerol accumulation and lipid droplet morphology by the novel thraustochytrid-specific lipid droplet protein 1 (TLDP1) in Aurantiochytrium limacinum F26-b.
Watanabe T, Sakiyama R, Iimi Y, Sekine S, Abe E, Nomura KH, Nomura K, Ishibashi Y, Okino N, Hayashi M, Ito M.
J Lipid Res. 2017 Oct 12. pii: jlr.M079897. doi: 10.1194/jlr.M079897. [Epub ahead of print] PMID: 29025869
Chondroitin 4-O-sulfotransferase is indispensable for sulfation of chondroitin and plays an important role in maintaining normal life span and oxidative stress responses in nematodes
Tomomi Izumikawa, Katsufumi Dejima, Yukiko Watamoto, Kazuko H Nomura, Nanako Kanaki, Marika Rikitake, Mai Tou, Daisuke Murata, Eri Yanagita, Ai Kano, Shohei Mitani, Kazuya Nomura and Hiroshi Kitagawa
Journal of Biological Chemistry (2016)
First Published on September 19, 2016 doi: 10.1074/jbc.M116.757328
RNAi screening of human glycogene orthologs in the nematode Caenorhabditis elegans and the construction of the C. elegans glycogene database (CGGDB)
Sayaka Akiyoshi, Kazuko H. Nomura, Katsufumi Dejima, Daisuke Murata, Ayako Matsuda, Nanako Kanaki, Tetsuro Takaki, Hiroyuki Mihara, Takayuki Nagaishi, Shuhei Furukawa, Keiko-Gengyo Ando, Sawako Yoshina, Shohei Mitani, Akira Togayachi, Yoshinori Suzuki, Toshihide Shikanai, Hisashi Narimatsu and Kazuya Nomura

Glycobiology (2014) doi: 10.1093/glycob/cwu080 First published online: August 4, 2014
Identification of leptospiral 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase released in the urine of infected hamsters
Takaya Segawa, Kazuko H Nomura, Sharon Yvette Angelina M Villanueva, Mitsumasa Saito, Kazuya Nomura, Nina G Gloriani and Shin-ichi Yoshida
BMC Microbiology 2014, 14:132 doi:10.1186/1471-2180-14-132
The acetyl-CoA transporter family SLC33
Yoshio Hirabayashi, Kazuko H. Nomura, Kazuya Nomura
Molecular Aspects of Medicine 34 (2013) 586-589. http://dx.doi.org/10.1016/j.mam.2012.05.009
In “The ABCs of membrane transporters in health and disease (SLC series)”
Edited by Matthias A. Hediger , Molecular Aspects of Medicine, Volume 34, Issues 2?3,
Pages 95-752 (April-June 2013) “)
NRFL-1, the C. elegans NHERF Orthologue, Interacts with Amino Acid Transporter 6 (AAT-6) for Age-Dependent Maintenance of AAT-6 on the Membrane
Kohei Hagiwara, Shushi Nagamori, Yasuhiro M. Umemura, Ryuichi Ohgaki, Hidekazu Tanaka, Daisuke Murata, Saya Nakagomi, Kazuko H. Nomura, Eriko Kage-Nakadai, Shohei Mitani, Kazuya Nomura, Yoshikatsu Kanai
PLoS ONE: Research Article, published 15 Aug 2012 10.1371/journal.pone.0043050
GPI-anchor Synthesis Is Indispensable for the Germline Development of the Nematode Caenorhabditis elegans
Daisuke Murata, Kazuko H. Nomura, Katsufumi Dejima, Souhei Mizuguchi, Nana Kawasaki, Yukari Matsuishi-Nakajima,Satsuki Ito, Keiko Gengyo-Ando, Eriko Kage-Nakadai, Shohei Mitani, and Kazuya Nomura
Mol. Biol. Cell 2012, 23(6) 982-995 mbc.E10-10-0855; First Published on February 1, 2012; doi:10.1091/mbc.E10-10-0855
Ceramide glucosyltransferase of the nematode Caenorhabditis elegans is involved in
oocyte formation and in early embryonic cell division

Kazuko H. Nomura; Daisuke Murata; Yasuhiro Hayashi; Katsufumi Dejima; Souhei Mizuguchi; Eriko Kage-Nakadai; Keiko Gengyo-Ando; Shohei Mitani; Yoshio Hirabayashi; Makoto Ito; Kazuya Nomura
Glycobiology 2011; 21 (6):834-848. doi: 10.1093/glycob/cwr019 (First published online: February 16, 2011)
Two Golgi-resident 3′ -phosphoadenosine 5′ -phosphosulfate transporters play distinct roles in heparan sulfate modifications and embryonic and larval development in Caenorhabditis elegans
Katsufumi Dejima, Daisuke Murata, Souhei Mizuguchi, Kazuko H. Nomura, Tomomi Izumikawa, Hiroshi Kitagawa, Keiko Gengyo-Ando, Sawako Yoshina, Tomomi Ichimiya, Shoko Nishihara, Shohei Mitani and Kazuya Nomura
J. Biol Chem. 2010, 285, 24717-24728. First Published on June 6, 2010, doi: 10.1074/jbc.M109.088229
Sulfation and related genes in Caenorhabditis elegans
Souhei Mizuguchi, Katsufumi Dejima and Kazuya Nomura
Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 21 (119), 179-191, 2009
A C. elegans glycolipid-binding galectin functions in host defense against bacterial infection
Hiroko Ideo, Keiko Fukushima, Keiko Gengyo-Ando, Shohei Mitani, Katsufumi Dejima, Kazuya Nomura, and Katsuko Yamashita
J Biol Chem. 2009, Sep 25: 284(39):26493-26501.
(Epub JBC published July 27, 2009 as doi:10.1074/jbc.M109.038257)
The ortholog of human solute carrier family 35 member B1 (UDP-galactose transporter-related protein 1) is involved in maintenance of ER homeostasis and essential for larval development in Caenorhabditis elegans
FASEB J. 2009 23: 2215-2225.
Published in advance as doi:10.1096/fj.08-123737
解説と総説
Sulfation and related genes in Caenorhabditis elegans
Souhei Mizuguchi, Katsufumi Dejima and Kazuya Nomura
Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 21 (119), 179-191, 2009
線虫をつかって硫酸化の謎をとく手がかりを探っています。
分子生物学 basic technique その51
モデル生物 線虫 Caenorhabditis elegans

村田大輔、野村一也
The Lung perspectives,
16 (4),529-532,2008 メディカルレビュー社発行
Uniprotデータベースの使い方に絞った線虫研究法の紹介です。
線虫の細胞分裂を制御する糖鎖コンドロイチン
水口惣平、野村和子、出嶋克史、宇山徹、北川裕之、菅原一幸、安藤恵子、三谷昌平、野村一也
蛋白質・核酸・酵素,49 (2), 141-147, 2004
Recent advances in the structural biology of chondroitin sulfate and dermatan sulfate
Sugahara K, Mikami T, Uyama T, Mizuguchi S, Nomura K, Kitagawa H.
Current Opinion in Structural Biology, 13 (5), 612-620, 2003
血液型物質と細胞接着
野村一也、水口惣平、但馬達哉、 野村和子
生化学, 72(2)、91-104、2000
Sugar chains in cell adhesion and cell division-Comparative glycomics throwing lights on glycobiology
Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 16 (88), 125-134, 2004
(糖鎖配列の進化の研究について)
単一細胞レベルで糖鎖の機能を探る―コンドロイチンプロテオグリカンを例として
野村一也、北川裕之、菅原一幸、水口惣平
実験医学, 22 (5), 921-926,2004
お勧めの本
2018年6月日本の糖鎖科学研究のロードマップが出版されました。私も執筆しておりますので是非ご覧ください。英語版もSpringer-Natureから発行されます。
「未来を創るグライコサイエンスー我が国のロードマップー」
2015年8月に
「糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック―創薬・医療から食品開発まで」(2015年、NTS出版)が発刊されました。
最新の糖鎖科学を展望するのには最適の本ですので、是非ご覧下さい。私達も「線虫でこそわかる糖鎖の新機能の探究」と題して線虫を用いた糖鎖科学研究の全貌についてやさしく解説しています。下にあげている「糖鎖科学の新展開」出版以降の最新の知見が含まれている糖鎖科学を知りたい人に最もおすすめの本です。
2014年12月末に出版されて私達も執筆しているGlycoscience :Biology and Medicine (Springer)は最新の糖鎖生物学の進展を含めて詳しく医学,生物学での糖鎖生物学について書かれている本で、一番のお勧めです。

糖鎖生物学の勉強の基礎には平林淳先生の以下の本がおすすめです。九大でも2009年5月に特別講義をしていただきました。
「糖鎖のはなし」(日刊工業新聞社)2008年

野村も分担執筆しています以下の本は糖鎖生物学の勉強にはおすすめです。

「糖鎖を知る―その素顔と病気への挑戦」(谷口直之、鈴木明身、西澤敏雄 編 2010年) 科学技術振興機構
(九大中央図書館、医学部、伊都図書館に所蔵しています。)糖鎖と病気、糖鎖と健康に興味のある方、お医者さんやマスコミ関係の方々に是非読んで頂きたいわかりやすい解説書です。

「糖鎖科学の新展開」(谷口直之、伊藤幸成編)NTS 2005年
とてもわかりやすい糖鎖生物学の概観に最適な本。

「第3の生命鎖 糖鎖の謎が今、解る」(科研費 特定領域研究Functional Glycomics研究成果公開発表シンポジュウムの記録) (クバプロ)2009年
市民公開講座のわかりやすい講演の記録